清畈村:清畈村，原名“清畈”，土地面積約134公頃。地形陡峭崎嶇，村莊沿著壹個斜坡而建，視野極佳。它是西菊島最熱鬧的村落、商圈和最大的港口，也是鄉公所所在地。
在馬祖方言中，外地人稱為“番”，清番則略有“為番”之意。就是早期的外國商船等潮，避風取水，和當地人交易。市場上到處都是華洋百貨，繁榮程度在馬祖列島最高，有“小香港”之稱。
抗日戰爭時期，親日偽“和平救世軍第二路軍”就駐紮在這裏。抗戰結束後，東海部隊遷入，司令部設在“山海世家”。大陸淪陷前，此地最為繁華，是媽祖設“鎮”的唯壹地方。它曾經管轄清東裏和李慶熙。1961左右，朝鮮戰爭爆發，美國西部公司進駐青番山，那裏曾經飄揚過壹段時間的美國國旗。所以清畈村在風采上很有人文歷史，在這裏講故事。
清帆村有很多店鋪，是島上最大的住宿中心，有餐廳、雜貨店、菜市場等等。鄉公所、村民代表會、鄉圖書館、郵局、衛生院、電信局、中小經橫國等重要社會教育機構都在這裏，還有客貨運輸的碼頭，是全鎮的交通和商業樞紐。港口旁邊的陳元帥廟是家鄉的信仰中心，香火鼎盛。
田窩村:位於西苴島倒三角以東的嶴口，地勢傾斜，田地多，又稱“田嶴”。現有村落分散在坳口東北山坡上，下轄菜圃坳，土地面積102公頃，約占全鄉面積的五分之壹。
清代後期，福建昌樂氏、嶺南陳氏等先民遷居，從事漁業和農耕。民國初年，種植罌粟，開設鴉片館，建立小酒庫，制鹽。田窩在國軍入關後人口壹度超過600人。1958年，唐錚建了壹座電影院，繁榮了壹陣子。後來人口外流，電視普及，就落到了姬神。
最近，政府投入巨資建設了直升機場、運輸場、電力公司、警察局、消防隊等。都是村裏建的，村裏有很多民宿。嶴口“四哨”據點兼具景觀和防禦功能；五十嶺觀景臺可以俯瞰附近廣闊的海上景觀；每年五月，王蘭花花開的時候，滿山遍野，美不勝收。
菜圃坳位於田窩村北部，地勢險峻。花崗巖巖脈形成礁、谷、崖等多樣的地質景觀，不僅具有觀光潛力，還具有學術研究價值。而且不斷變化的洋流給這裏帶來了豐富的魚類，成為漁民最喜歡的海上漁場。
西樵村:西樵村位於西樵島西部。根據轄區“西路”和“昆丘”命名為西橋村。當時，東海遊擊隊在昆丘建立了“樂康新村”。這個村莊地勢高，視野好。它西望中國大陸昌樂縣梅花鎮，南望平潭島。
國軍進入後，師部與之相鄰，許多軍隊包圍了村莊。西劇英雄館就建在附近的緩坡上。除了種菜，開店做小意外，小吃，洗衣，衛生間，小說出租，網吧等。，村裏的居民給村子帶來了小財富。
在秋喜村聯合辦公中心的左側，有壹條通往清畈村“山海家”的小道，中間有壹個觀景臺。大王廟旁邊還有壹條小道，直通“仙洞”，再到昆丘。附近海域有壹座蛇山，是群島礁。退潮時，附近幹凈的弧形沙灘會露出來，漲潮時，只會停留在島礁上方。從遠處看，它像壹條巨大的蟒蛇在海裏盤旋，因此得名“蛇山”。
夏季，蛇山已成為大群燕鷗的聚集地，神話中的“黑嘴鳳頭燕鷗”曾在此出現。1989年被宣布為馬祖地區的燕鷗保護區，每年4月至9月禁止漁民上岸。
大坪村:大坪村位於東菊島中南部，轄茌平、大埔、孟窩三個自然村。這些村莊是以大埔和茌平命名的。島內的政治、教育、商業中心——茌平集，是媽祖地區少有的臨海村落。
大坪村是東聚人口最多的村落，開發日期可以追溯到清朝以前。村民從事商業，小吃店、雜貨、土特產和電子遊戲商店壹應俱全，村莊周圍還有農田，是島上重要的水果和蔬菜來源。村裏有東巨小學、電信局、郵局、自來水廠、消防隊、派出所、衛生院。早些年甚至還有電影院“中正堂”，與英雄館和村公所相鄰。周圍駐紮著軍隊，還有通往輔政、大埔、蒙臥的道路。
大埔位於該村的南端，是北風的最佳避難所。這裏曾經是壹個繁華的漁村，但民國50年後，政商人士遷到茌平，此地逐漸衰落。
蒙臥港，位於東苴島西南，是壹個安靜的沙港，也是所有島嶼進出東苴的門戶。蒙沃現在只住三四戶人家，港口上方有直升機場。
輔政村:輔政村是“富力”和“奧正”的總稱。位於東苴島東北端，雖然大部分居民已經搬遷，但以海崖為依托修建的閩東聚落仍保存完好。山頂有壹座著名的東巨燈塔，被列為國家二級古跡。
整個村莊背靠燈塔而建，閩東風格的花崗巖石屋緊湊地錯落在小平地上。雖然時代變了，人去樓空，但依山傍海的漁村情境，和壹座印度風格的石屋，彎彎曲曲的窄巷，遠遠看去，就像壹座石頭城。村子看起來很樸素，很像陶淵明筆下的世外桃源。傍晚時分，站在港灣旁的涼亭靠著欄桿俯瞰，火紅的太陽輪漸漸西沈，給大海染上了壹層異彩，常常讓遊客駐足流連於此地的古樸自然之美。
輔政港屬於面向西北的澳門入海口，是壹個樸素的避風港。澳門的河口覆蓋著像金子壹樣閃閃發光的細沙，面前是美麗而廣闊的潮間帶，盛產蛤蜊。