(1)革命歷史檔案
革命歷史檔案主要包括1928至1949年間閩中地下黨組織的發展及在泉州的分布情況、地下黨組織經費來源及其管理文件、黨員登記表、來往函件等。
(二)中華民國檔案館
此全案為1949之前國立海江學校、晉江私立培源中學、全州醫院、惠始醫院的檔案收集。學校檔案主要有學籍檔案和校刊資料，此外還有地方國民黨各級人員的姓名和有關人員的任免、保安訓練所的學籍表、國民黨政府的犯罪檔案、被摧毀的中國地下黨組織的資料等。
(3)中華人民共和國檔案館
中華人民共和國檔案館是泉州解放以來黨政機關、社會團體、企事業單位形成的檔案，反映了近50年來該市政治、經濟、文化、教育和城市建設的歷史面貌。主要內容包括市委、市政府及其所屬部門制定的有關工業、交通、農業、林業、漁業、城市管理、科學、文化、教育、衛生、體育等方面的政策、規章和決定；會議紀要；黨代會、人代會的材料，政府工作、選舉工作、統戰工作的報告、決議、計劃、總結和情況報告，幹部任免、紀律處分、機構設置和體制調整的檔案材料；各種年度報告和統計報表；工人、青年和婦女會議材料；表彰先進材料，評選勞動模範；基本業務信息表、經濟簡報、資金轉化等材料；優撫、復員軍人安置、勞動調配、勞動工資、招工等工作的通知和規定；僑務、宗教、文化、教育、衛生等方面的管理規定、計劃、總結、通知、清單，以及會計檔案、人口普查、婚姻登記、工業普查等專業檔案材料；城市規劃、水利建設、環境保護調查等科技檔案；在“三反”、“五反”、處理幹部、肅反、“整風”、“社會教育”、“文化大革命”等運動中形成的檔案材料。
此外，泉州市檔案館還建立了碑文、名人、大事、觀感等專項檔案。館內收藏國家領導人和社會知名人士題詞30余幅，大部分為真跡，包括:孫中山先生1920贈培源中學題詞“* * *入大同”；1980年，宋慶齡為培源中學題詞“育人為國”；李鵬、李嵐清等黨和國家前領導人題詞；謝覺哉、費孝通、朱學範題詞勉勵泉州人民弘揚泉州精神，振興經濟，發展教育，建設社會主義新泉州。目前，該館已收藏書法家、作家、醫學專家、農業專家、表演藝術家等23位泉州名人的檔案近百卷。檔案的主要內容包括各種證書、獎章、自傳、事跡材料、照片、作品等。重大活動檔案是指近十年來本市收集的壹些重大活動的檔案，如“海斯”、“藝術節”、“旅遊節”等。印象檔案主要是泉州解放以來壹些黨委、政府機關使用的工作印章，館藏有311枚。
(四)聲像和實物檔案
泉州市檔案館的聲像檔案很多，有照片5000多張，音像光盤***120盤。聲像檔案的主要內容包括:泉州近50年來的經濟建設、文化藝術活動、重大歷史事件、各級領導視察檢查工作等。
此外，館藏實物檔案700余件，包括字畫、碑刻、器物、藝術品、印章等。這些物品主要是泉州市委市政府在各種對外交流和外事活動中接受的禮品，也有壹些物品是社會熱心人士捐贈的。
(5)書籍和資料
泉州市檔案館現有資料兩萬余卷，包括:政策法律文件匯編、泉州市國民經濟統計年鑒；地方史料；宗教、同鄉會、研究會、僑務信息；報紙(人民日報、福建日報、泉州晚報及民國時期的部分報紙)，有關城市規劃、氣象、自然災害等方面的刊物和信息。書籍主要包括公共書籍(包括哲學、社科、政治、經濟、歷史、地理、文學、法規)、工具書、泉州地方誌、族譜等。