1910年，酉陽知府楊兆龍創辦“酉陽中學”，設在考邦，招收酉、修、錢、彭四縣學生200余人。
1913年，“酉陽中學”更名為“酉樹中學”。次年，縣內“府明軍”造反，社會秩序混亂，學校停辦。
1924年，學校恢復並更名為“尤、秀、錢、彭中學”，招生四縣，共A、b兩個班，1925年，省五中開始招生，但尤、秀、錢、彭四校停辦，兩個班的學生並入學校。
1933年，經四川省教育廳批準，酉陽縣簡易師範學校成立，校址在試驗棚。簡易師範學校是培養酉陽小學教師的學校，學制四年，招收小學畢業生。前前後後辦了5個班，畢業了100人左右。
1941年，四川省政府責令酉陽縣簡易師範學校改組為縣初級中學，省教育廳於同年8月21日正式命名為“酉陽縣初級中學”。1942年秋，增設女子部，酉陽縣初級中學開始出現女生。1949年冬，酉陽解放時，她已畢業17班，其中男生12班，女生5班。
6月1950，11，川東行署將酉陽縣初級中學改為“川東酉陽中學”。
1953，“川東酉陽中學”更名為“酉陽第壹初級中學”。
1958年，中共酉陽縣委決定在酉宜初級中學建立完全中學。1958年9月，四川省涪陵專員辦批準四川省酉陽第壹初級中學更名為“四川省酉陽縣第二中學”。1960年，學校已經成為壹所擁有21個班級的大型完全中學。
1975，在離學校30裏的板溪鄉大毛坡建立“五七”分校，貧困中農子女就近入學。連續招收4個班，學生約250人，實行半工半讀。
9月26日，1980，酉陽縣革委會將學校命名為“酉陽縣第二中學”。
1983年，酉陽自治縣成立，校名“酉陽土家族苗族自治縣第二中學”。
2005年4月，學校順利實現了爭創市級重點中學的目標，將“酉陽土家族苗族自治縣第二中學”更名為“重慶市酉陽第二中學”。