1)文化方面。
兩種生產模式都蘊含著追求完美的文化:精益生產以“完美”為目標；六適馬提出的六適馬標準也是壹個近乎完美的質量目標。然而，兩種生產文化的起源不同，因此兩種模式的操作層面存在許多差異。精益生產源於日本文化環境，而六適馬源於美國文化氛圍。歐美人註重邏輯分析，質量管理受泰勒管理思想影響，強調專業化。質量管理由質量管理技術人員完成，即專業技術人員制定技術標準和操作標準，操作人員按標準作業。東方文化強調集體，尋求融入，註重尋求集體和社會的認同。日本的專業化不強，甚至技術人員在壹個企業的設計、生產、質量管理等各個部門輪崗。他們強調以人為本，充分調動人的積極性。
2)戰略起點與質量密切相關。
精益生產模式以成本、質量和縮短交付周期為基礎。精益思想的首要原則——確定價值是質量管理的範疇，而作為其核心內容之壹的JIT，需要高質量管理水平作為保障。六適馬管理本身就是從質量管理發展而來的壹種管理模式，它以顧客滿意為中心，充分利用質量管理的各種工具，吸收和運用當前的質量管理理念。
3)運營管理模式。
它們的實現與PDCA類似，都是基於過程管理。而精益生產是以系統的觀點，基於增值過程考慮整個生產鏈的管理，基於整個生產系統的資源有效配置。精益生產強調現場的重要性，是壹種基於現場改善管理的模式。六適馬是壹種基於項目管理的模式。通過DMAIC計劃的實施，有計劃、有步驟地完成項目目標。它采用自上而下的管理模式，將倡導者、黑帶、綠帶和員工結合起來。
4)過程改進方法。
兩者都采用持續改進的方式，兩種模式都強調流程改進不能壹次完成，組織必須不斷診斷和改進業務流程。但這兩種模式的改進方式是不同的。精益生產采用漸進式持續改進策略(Kaizen)，沿著既定的技術路徑，通過持續改進提供更好的產品或服務，不需要大的投入。六適馬管理強調突破性變革，要求每壹個項目都要有突破性的成果，能給組織帶來巨大的財務收益，投入也大。
5)員工培訓。
兩種模式都強調人員對過程改進的重要性，所以都重視人員培訓和管理，只是側重點不同。精益生產非常重視對普通員工的培訓，主要通過“做中學”來進行，有助於培養員工的現場技能。精益生產使員工通過輪崗培訓獲得多種技能。六適馬管理註重對管理人員的系統培訓，強調黑帶和綠帶的作用，要求他們具備更多的統計知識和解決問題的能力。
6)分析問題的方法不同。
精益生產強調現場專家的作用。如果現場出現問題，員工有權停止生產並處理問題，這就需要員工的操作技能和現場解決問題的能力。六適馬註重量化分析，通過量化分析指標進行決策，避免靠經驗解決問題。
7)關註對象不同，但目標壹致。
精益生產模式的重點是消除浪費，通過消除浪費實現資源效率最大化。六適馬關註變異。它視波動為敵人，努力減少和消除波動。消除浪費和減少變異都是為了價值。變異是產生浪費的壹種方式，減少變異才能減少浪費。
通過比較可以看出，精益生產和六適馬管理在文化追求、戰略基礎、目的、流程改進模式、人員理解上是壹致的。兩者的區別主要在操作層面，比如分析問題的方法，員工培訓的側重點，運作的方式，但是可以看出這些區別並不是對立的，而是互補的。