學校成立於1948(工農速成中學)。
1952，哈爾濱市第九中學正式命名，有初高中。高壹有兩個班，招收壹些哈爾濱的學生，主要是印尼歸國留學的華僑子弟。壹年級有10個班，不僅招收部分市區走讀生，還主要招收居住在哈爾濱郊區農村的學生。學生大多來自黎明鄉和電力區平房，也有少數烈士和孤兒。
從1952到1956，學校黨支部和行政領導認真貫徹黨的知識分子政策，九中以幹群關系好、教職工團結著稱。1956，市教育局、市委文教部門認為九中黨支部落實知識分子政策好，統戰工作做得好，在全市引進推廣九中經驗。
從1955的冬季至日到1956的春季，全國掀起了農業合作化的高潮。* * *團委號召學校教師加入工作隊，組織師生下鄉參加農業合作化運動。九中* * *派出17隊，組織了壹支50人左右的文藝宣傳隊，由5名老師帶隊。各隊由區政府分配到郊區17自然村，文藝宣傳隊到各村巡回宣傳。經過兩個多月的工作，先進學會成立了。這次社會實踐大大提高了老師和學生。(1957 ─1961年)
1957年夏天，松花江發生了建國以來第壹次大洪水。九中師生夜以繼日地投入抗洪救災，與全市人民壹起戰勝了壹次又壹次洪峰。30多名師生被評為市防汛勞動模範，九中被評為市防汛先進單位。哈爾濱57年抗洪勝利，蘊含著九中師生不可磨滅的功績。
1957，反右擴張。學校主要領導被劃為嚴重右派，受到降薪處分。九中骨幹教師中有6人被定為帶帽子的右翼分子，2人被定為壞分子並被清除出教工隊伍送去工廠工作，另外幾名教師被定為右翼分子和右翼分子。還有幾名青年骨幹教師被“白旗”、批評、記入檔案。王濤同誌也因為從九中調出材料，送回哈爾濱控制，被劃為嚴重右派。反右膨脹極大地損害了九中的幹部和教師，嚴重影響了九中的發展。
1958年，在大躍進的大背景下，九中的學生走出校門與工農結合，在學校的組織下，勘探、冶煉焦炭、冶煉鋼鐵、興辦工廠。這期間，學校買了6臺車床，辦起了工廠。在電機廠的幫助下，校園裏建起了壹座小高爐。有的師生去亞麻廠煉鐵，去電機廠打工，下鄉參加夏鋤秋收。課堂教學不再是教育的主要形式。在此期間，九中的體操在全市小有名氣，多次獲得全市中學生體操競賽組第壹名。(1961年──1966年6月)
1961年，在黨中央的領導下，全國人民基本克服了三年自然災害，國家實行“調整、整頓、充實、提高”的八字方針，經濟逐步恢復，教育開始步入正軌。為了充實學校幹部隊伍，工礦企業支援教育部門，壹些幹部加入學校領導班子。市教育局領導根據省教育廳的指示和省政府的要求，決定辦好九中，對九中的領導班子和教職工隊伍進行了較大調整。原校領導全部調離，中層幹部更換。韓光同誌由哈爾濱電機廠辦公室主任調任第九中學(1962 ─1970)校長、黨支部書記。
韓光同誌是有抱負的。他從九中和全市中學的實際出發，提出:“全面貫徹黨的教育方針，辦好德智體全面發展的學校”。當時全市只有四所重點中學，分別是三中、六中、壹中、十八中。他提出了“把三中、六中、十八中辦成三中、六中、九中、十八中”的目標，決心把九中辦成市重點中學。
貫徹黨的知識分子政策，充分發揮邵、郭松齡、叢軍、臧光東等教研帶頭人的骨幹作用。政治環境更加寬松，教師積極性調動起來，教育教學質量大大提高。
經過壹年的努力，九中教學樓裝修完畢，教學設備充實，校園規劃整潔科學。韓光同誌親自指揮師生進行了幾個星期的建校工作，建成了250米的田徑場(6條跑道)，並在場內開辟了壹個少年足球場(70米×36米)。
重視德育，建立班級責任制，要求班級成員自習課要上教室，站在班級前面和學生壹起做操，親自負責大型集會。所以，62年後，大規模的學校聚會是無聲的，有序的，有效的。在智育方面，強調教師的專業學習和備課，要求教師對教材精通，知識準確，講解熟練，並不斷調整各科教師，調入工作認真、專業能力強的骨幹教師，調出不稱職的教師，使九中教師隊伍提高壹個大水平。對學生的要求是:嚴格遵守課堂紀律，上課認真聽講，課後認真復習，及時向老師提問進行指導。經過兩年的努力，學生的學習成績和高考成績都有了很大的提高。在體育工作中，我們堅持“普及與提高相結合，以普及促提高，以提高促普及”的原則。在抓好體育課和抓好每周兩次的課外體育活動的同時，學校組建了田徑、男籃、女籃、足球、乒乓球、體操、冰球、速滑、花樣滑冰九個運動隊，湧現出壹批省市優秀運動員和優秀運動隊。學校被評為全市體育先進單位。女子乒乓球隊多次獲得哈爾濱市中學生團體冠軍和單打冠軍，三次代表黑龍江省參加全國比賽並取得好成績。董梁書還受到了周恩來總理的接見。男足獲得省市青少年足球錦標賽冠軍，代表黑龍江省參加全國比賽；冰球隊獲得哈爾濱冰球季軍；田徑隊的成績更是令人刮目相看。在1966哈爾濱市中學生田徑運動會上，高中女子田徑隊包攬了除女子跳遠外的所有冠軍，並被市教育局和市體委選拔參加在青島舉行的全國中學生田徑運動會。但由於文革的爆發，九中田徑隊失去了這個千載難逢的機會。
在韓光同誌的領導下，在全體師生的共同努力下，學校於1964順利通過了上級教育行政部門的驗收，被命名為落實五十條規定學校，成為哈爾濱市名校之壹。
65438至0965年，學校投入大量人力物力在賓縣青山公社建立了青年中心，動員部分高中、初中畢業生到農村定居務農。65屆高中畢業生虞書、宋立成下鄉落戶，在全市影響很大。
由於哈爾濱教育的發展，1962年秋，學校除了4個高年級班外，還設立了24個低年級班。1963年夏天，12初壹班和幾個初二班從九中分離出來，和老師們壹起成立了新的初中，即哈爾濱市第四十九中學。1964年秋，從九中分出八個高二班和四個高三班，新建初級中學，即哈爾濱市第六十四中學。學校從第九中學的兩部分班級開始。是九中為哈爾濱教育發展做出的巨大貢獻，也是九中的光輝歷史。(1966 ─1973)
1966，文革爆發。
韓光同誌被打成“資本主義當權派”，被醜化為“三球”校長(乒乓球、足球、冰球)，在牛棚裏度過了十個春秋。
九中是文革的重災區。6月1966到6月1971，是學校最混亂的時期。學生老師造反，拉走資派，打派系戰，學生下鄉，教師下鄉插隊，復課搞革命，無非就是學毛主席語錄，看報。(1976 ─1984)
1976 10，四人幫垮臺了，各條戰線完全亂了套。在鄧小平同誌的關懷下，全國重點中學開始恢復建設。
1978市教育局根據歷史地理條件，批準第九中學為市重點中學，任命宋煥珍同誌為校長兼黨支部書記，任命吳玉卓同誌為79年黨支部書記。從1978暑期開始，在動力區選拔學生，有三年制初中，兩年制高中。80年和81年，高考錄取率大概是51%，不太理想。但是81高考文科成績不錯，升學率達到75%。畢業生張健，哈爾濱高考文科狀元，為學校爭光。
1980，九中對原有磚木結構教學樓進行了修繕，將木質走廊改為水磨石地面，並將走廊兩側的教室用鋼筋混凝土連接起來，有效地控制了建築物的傾斜，及時搶救了危樓，使其安全使用至今。
1980年6月4日，畢業班張群因追求本班壹名女同學遭拒，通過盜竊沖鋒槍、手槍、手榴彈等武器進行報復，導致“六四槍擊事件”。張風臣老師因殺害女孩並打傷多名師生，為保護學生受重傷，終身癱瘓，導致早逝。郎永年、楊、蔡田莊、邢逸夫等老師受傷；叢軍、黃曼玲等老師冒著生命危險將被追捕的女學生藏在語文組辦公室的課桌下；校醫畢艷琴不顧個人安危組織學生搶救受傷師生；彭澤仁老師冒著生命危險靠近張群，勸他放下武器。雖然沒有起到作用，但是對減少師生的傷害起到了壹定的作用。這些老師的大無畏精神和貢獻將被銘記在學校的歷史上，這是後世師生永遠不會忘記的。
從1980到1981，九中師資力量相對薄弱，缺乏數學、科學、文化、外語等教學骨幹。不僅高中能實現小循環，連畢業班都捉襟見肘，無法匹敵。如何培養和提高原有教師和新分配教師成為當務之急。此時，宋煥珍校長和分管教學的魏振國副校長先後參加了省教育學院舉辦的教育行政幹部培訓班，系統學習了現代教育學、心理學和管理學。蘇霍姆林斯基和贊科夫的教育理論、馬斯洛的人的需求層次理論、吉爾福德的心理學等，對它們都很新鮮，也很有啟發。他們試圖通過組織教師尤其是青年教師學習現代教育理論來指導教學實踐，以此作為提高青年教師教學水平的手段，作為師資隊伍建設的捷徑。在“向科學種田要產出”口號的鼓舞下，他們提出了“向教育研究要質量”的口號，開始走上了壹條艱難的教育研究之路。(1984夏季-1999 10月份)
1984暑期，市教委根據上級幹部年輕化的指示精神，對重點中學領導班子進行了調整。宋煥珍同誌、吳玉卓同誌退居二線任顧問，宋煥珍同誌任九中教研室主任，主抓教學科研。
陳若珍同誌任第九中學校長(1984-1999夏)，張若華同誌任第九中學黨支部書記(1984-1994)。從此，九中進入了快速發展期。學校逐漸形成規模，形成了良好的校風、教風、學風，教育教學成績不斷攀升。學校各方面建設逐年加緊，在哈爾濱教育界頗有名氣。
1989，九中開始實行校長負責制。1994年，陳若珍同誌擔任校長兼總黨支部書記，負責全校黨政工作。張若華同誌退休了。正如柳斌同誌指出的:“好校長就是好學校”。在陳若珍同誌的帶領下，九中各方面工作不斷走向規範化，形成規模，體現特色。
從1984年開始，省重點中學面向全市招生，壹大批動力區的優秀學生考上了三中、師大附中等省重點中學。因為九中當時是市重點中學，只能在省重點選拔後招生，生源下降。它在1987年和1988年辦學時遇到了很大困難。陳若珍同誌、張若華同誌團結全校教職工，發揮九中教育科研優勢，克服困難，使九中87、88屆高考錄取率保持在85%以上。市教委領導高度評價九中為“教學質量信得過單位”。1985年，哈爾濱實行初高中分離，1988年，九中成為純高中。自1989年以來，第九中學的教學質量穩步提高。91屆，王鑄獲得哈爾濱高考文科狀元。自1995年以來，高考升學率壹直穩定在95%以上，1997年達到99.18%，1998年升學率達到100%。李剛以689的優異成績獲得哈爾濱高考理科狀元。朔陽和徐飛都是壹樣的。九中聲譽不斷提升，社會影響力不斷擴大，各項工作成效顯著。
1998 9月19日，九中以“團結奮鬥，爭創輝煌”為主題，隆重舉行建校50周年校慶活動。會議由孔同誌主持。CPPCC主席、省人大副主任山、省人大副主任王生活、省教委副省長王、省教委主任等省、市、教育局及兄弟學校領導出席了慶祝活動。九中老校長韓光、宋煥珍，老書記吳玉卓、張若華也出席了慶祝活動。副市長程幼東、局長劉淑敏作了重要講話。陳若珍校長做主題演講。本次活動盤點了九中的發展歷程，總結了經驗。(1999 9月至今)
1999 10陳若珍同誌退休後，在九中擔任和平中學校長。隨後的十年，九中在四屆領導班子的領導下，以鄧小平理論和三個代表重要思想為指導，貫徹落實科學發展觀，堅持走科研強校、內涵發展之路，在繼承中開拓，在開拓中創新，在創新中發展，學校各項事業邁上新臺階。
1999年9月，孔同誌任黨總支書記、主席。
孔(在職:1999，9-2002，1)，女，黨員，特級教師。歷任哈九中學學年主任，哈九中學教學副校長，哈九中學黨支部書記、校長，哈三中學黨支部書記、校長。現任哈爾濱市教育局副局長。孔於凡在任期間，確立了“以人為本”的總目標，以德立校，以培養學生創新精神和實踐能力為核心，以優化教學質量為中心，以德育為魂，以教師隊伍建設為重點，以教育科研為先導，以標準化建設為保障，為社會主義建設培養高素質人才。同時提出了“五個堅持”的管理目標，高度重視學生的主體性和個性提升，在課程改革上進行廣泛深入的探索，使九中成為全省首批省級示範高中。
5438年6月+2002年10月，叢同誌任第九中學黨總支書記、校長。
叢(在職:2002，1—2007，1)，男，中共黨員，哈爾濱市民主促進會副主席。歷任哈爾濱市第三中學教務處主任、市教育研究所教師培訓中心主任、哈爾濱市第三中學副校長、哈爾濱市第九中學黨支部書記、校長。現任市教育局副局長。他在任期間，以“辦人民滿意的學校”為宗旨，堅持“以人為本、依法治校、以德建校、科研強校”的辦學理念，探索出壹條內在強大、外在形象提升、質量提升、影響擴大的辦學之路。在這五年中，從校長深入貫徹"以人為本"的理念，本著公平、公正、公開的原則，加強科學、民主、依法治理，大力推進校務公開。同時，多方籌措資金，改善辦學條件，擴大辦學規模，建立江北校區，從根本上改變了九中的辦學環境，實現了跨越式發展。
2007年6月5438+10月，趙文祥同誌任第九中學黨總支書記、校長。
趙文祥(在職時間:2007，1—2007年7月)，男，黨員，市民主促進會會員，中國優秀教師。歷任哈爾濱三中教務處主任，哈爾濱三中黨支部副書記、副校長，哈爾濱九中黨支部書記、校長。現任哈爾濱市第三中學黨總支書記、校長。在任期間，他繼承了學校的優良傳統，明確提出了創建國家級知名中學的發展目標，並為實現目標做出了積極努力。
2007年7月，九中副校長牛家彬同誌被市教育局黨委任命為九中黨總支副書記，分管全面工作。2007年6月，正式擔任九中黨總支書記、校長。
牛佳彬(在職時間:2007年7月2014)，女，黨員，特級教師。歷任哈爾濱市第六中學學年主任、哈爾濱師範學校副校長、哈爾濱市第九中學教學副校長、哈爾濱市第九中學黨支部副書記、副校長。現任哈爾濱市第九中學黨總支書記、校長。牛家彬擔任校長後，繼承了九中優秀的辦學傳統和工作作風，進壹步提出了“以人為本、以德為本、以學為本、以質為本”的辦學理念。以人為本，即關註教師的成長和學生的成功；以德為本，即倡導教師正直，倡導學生明確責任，實事求是；學會學習是實踐教師的終身學習和學生的自主學習；以質強基，就是要實現教師的專業化和學生的素質化。積極探索為國家培養高素質人才，實現學校的可持續發展。
何泉(2014-至今)在何泉校長的帶領下，哈爾濱九中2014年高考再創輝煌，理科平均分612，全市第壹，文科平均分599，全市第壹。理科重點率99.7%，文科重點率99%(文理科只有1學生不上重點)。