1，培養目標不同
專業學位碩士:專業學位碩士註重學術與專業的緊密結合，註重培養專業背景明顯的高層次人才。擁有專業學位的畢業生可以從事工程師、醫生、教師、律師和會計師等工作。
學術型碩士:學術型碩士按不同專業學科設置，偏重理論和研究，主要培養大學教師和科研機構研究人員。
2.不同的教學方法
碩士:碩士的教學方式比較靈活，主要適合在職人士報考。其教學方式包括在職和脫產。在職模式為周末班和集中班，脫產模式為全日制。
碩士:碩士是全日制學習，即考生在取得錄取資格後需要休班，周壹至周五主要在工作日上課。
3.適用條件不同。
專業學位碩士:部分專業與學術型碩士要求相同。
但工商管理、公共管理、工程管理、旅遊管理、工程碩士中的項目管理、教育碩士中的教育管理、體育碩士中的競賽組織等專業，要求專科畢業至少5年，或本科畢業至少3年，或取得碩士/博士學位至少2年，方可報考。
學歷碩士:壹般專科、本科及以上學歷均可報考，除專科要求畢業至少2年方可報考外，本科及以上學歷對畢業年限無要求，即應屆和往屆學生均可報考。
4.招生專業不同。
碩士:招生專業相對有限，包括金融學、應用心理學、口腔醫學、應用統計學、翻譯、公共衛生、稅務、新聞與傳播學、護理學、國際商務、出版、藥學、保險、文物與博物館、中醫藥、資產評估、建築學、軍事、審計、工程、工商管理、法學、城市規劃。
以及公共管理、社會工作、農業推廣、會計、警察、獸醫學、旅遊管理、教育、風景園林、圖書情報、體育、林學、工程管理、漢語國際教育、臨床醫學、藝術、中醫藥等40個專業。
學位碩士:招生專業包括哲學、經濟學、法學、教育學、文學、歷史學、理學、工學、農學、醫學、軍事學、管理學、藝術學、13學科及其壹級學科和二級學科，涵蓋所有專業方向。
5.學制不同，學費不同。
碩士:碩士的時間長短根據院校的安排而有所不同。壹般從1-3年不等，學費跨度從2-3萬到幾十萬不等。
學位碩士:碩士學制壹般為3年，學生需要根據高校的課表進行學習，課程學費壹般在壹萬左右。