1、建設用地規劃許可證手續更加復雜，條件比建設工程規劃許可證更多。
建設用地規劃許可證是政府部門指導公民按照城鄉總體規劃和個人生產生活居住等需要，到所在轄區居委會，申請填寫《擬建項目規劃許可證（原址、選址建房意見書）》後，經過消防、規劃等部門受理審結同意，並在規劃區內或按照城鄉總體規劃建設，依法核發的法律憑證、準建手續。
建設工程規劃許可證是城鄉規劃行政主管部是到所在轄區居委會，申請填寫《擬建工程規劃許可證（原址、選址建房意見書）或（原址建房同意書）》後，經過城鄉消防、規劃部門受理審結，對社會生產生活均無影響，無不良嚴重違法記錄，簽字同意，可在規劃區內或按照《城鄉總體規劃》有序建設，超過三層以上的要有政策性手續，依法核發的準建手續、法律憑證。
2、兩者核發行政行政主體也不同。建設用地規劃許可證經過消防、規劃等部門受理審結同意，並在規劃區內或按照城鄉總體規劃建設，依法核發的法律憑證、準建手續。建設工程規劃許可證僅需要經過城鄉消防、規劃部門受理審結。
3、建設用地規劃許可證是同意妳對這塊地有使用權後，用於建設項目用地，不能作為它用，是土地建設主管部門審批的，超過壹定用地面積需要國務院批準。