海上很多災難都和東海龍宮太子有關。伢子是個狠毒的家夥。他暗中煉坤大法，企圖稱霸東海。他不想昏迷不醒露出真面目，被漁民抓住。感謝年輕沈默的母親的好心，纏著哥哥把芽子贖回來放生。伢子得救後，她不想報答。相反，她不厭其煩地迫害漁民進行報復。他的海妖龔燕到處騷擾人民，袁林不得不請求縣令王詩琪降妖。不想宣彤練得太淺，龔燕逃了，王詩琪的兒子被龔燕報復成了廢人。東海龍王敖廣年老體弱，疾病纏身。在妃子的誘惑下，他逐漸隱退，卻在二兒子和四兒子之間舉棋不定。我得知我決定除掉我的好心腸的競爭對手，四哥。然而，犰狳由強大的海龜將軍護送。如果妳想除掉犰狳，妳必須先殺死烏龜將軍。睚眥帶領親信包圍並殺死龜將軍。龜將軍倉皇逃往東海，下落不明。
墨娘得到了赤足仙子贈送的青銅符號，日夜苦讀，漸漸的越來越好，只覺精神依戀，法力澎湃。觀音菩薩還送給她壹對賦有神通的銀鐲子，這兩件寶貝成了她的隨身器物。後來每當有人在海上遇險，墨娘的腦子裏就充滿了紅光，於是她的元神就飛到事發海域護船救人。墨娘見天氣很有效果，深得左鄰右舍的信任，但就在這時，海妖突然報復，墨娘的哥哥和陸子貴家的兩個兒子死於海難。陸子貴等人把兒子的死歸罪於莫娘。從哥哥的死，莫娘覺得島上壹定有醫生。她向父親借錢準備行醫，最後感動了父母，支持了事業。鄰島發生瘟疫，漁民桂花全家都死在船上。村民們害怕瘟疫的傳染。在陸子貴的倡議下，要把桂花活活燒死，消除傳染源。王，莫娘的善良公正的母親，毅然挺身而出，保護桂花。墨娘決定在魔女的照顧下去魔島取聖水。結果處理海妖耽誤了時機，桂花得救了，王最終也因為病得太重而死了。莫娘將聖水灑滿了島嶼，拯救了周圍的漁民。
在壹次與海妖的交易中，墨娘救下了欽差大臣吳宗倫率領的官船。吳宗倫事後前來道謝，兩人相談甚歡。墨娘通過吳宗倫的指點，在外面學到了很多重要的東西。兩個年輕人的交往引起了莫娘青梅竹馬楊聖泉的嫉妒。楊壹直單戀著墨娘，墨娘壹心救人，從沒想過自己的終身大事。
盤踞在黑甲島的海盜搶劫貨物和財富。林想見泉州知府，請求他出兵剿滅海盜。與海盜暗中勾結的王詩琪拒絕出兵。他還假設要運軍械，讓墨娘護送。墨娘欣然同意。墨娘戰勝了海妖，將船安全送到碼頭，卻發現船上裝滿了食物。原來王賊趁機囤積糧食和大米發大財。墨娘大怒，領著眾人搶食。王詩琪惱羞成怒，設計將莫娘桂花投入大牢，被判死刑。在此期間，他想強迫墨娘嫁給他的兒子王筱凡。為了救妹妹，五姐林妙珠答應嫁給王筱凡。
妙珠結婚後，知道丈夫王筱凡不僅瘸腿，而且脾氣暴躁，經常打罵她。妙珠從貢帕那裏得知，王筱凡的腿是她父親的克星。出於對王家的愧疚，她逆來順受，希望用真情感化丈夫，獲得真正的生活。
睚眥篡位的欲望正在升級。最後，他聯合自己的親信，將自己的親弟弟殺死在海裏。高手對決造成了壹場大海難。莫娘在許的婚禮上喝醉了。雖然她飛到了海上事故現場，但功力不足，楊聖泉葬身海底。她帶著楊聖泉的父母去找楊聖泉的屍體。幸運的是，楊聖泉奇跡般地復活了。楊聖泉活了下來，但大腦因為受到刺激而失憶，這讓墨娘和楊家福的妻子百般無奈。
龍王死後，悲痛欲絕，嚴加戒備，只字不提退隱之事。雅姿試圖以龍王的名義傷害人類。死的人越多，恨龍王的人就越多。玉帝遲早壹定會廢掉龍王，在東海重新建立新主人。以雅姿的影響力，自然是不二之選。於是，他下令殺死自己的親信。在壹次與魔女的搏鬥中，還沒有經驗的墨娘在與魔女的搏鬥中受了重傷。
有壹次巡查，袁林組織數百村民討伐海盜，卻遇到了毒爪王，第二個海盜據點的主人，把袁林和幾個村民抓傷了。面對傷害，莫娘無可奈何，因為這種毒只有長在深海底部的草才能治好。楊聖泉看到“毒爪王”留下的獨特傷口，驚呆了。他轉身離開了。很快，他收集了毒草，救了受傷的村民。墨娘納悶，楊聖泉怎麽能從深海裏快速采集奇藥。結合楊聖泉的種種怪異表現，莫娘懷疑這個楊聖泉不是另壹個楊聖泉。
水怪龔燕襲擊了陸三的兒媳和她五歲的兒子，並把他們救給了莫娘。陸三的媳婦感謝林姑娘的好意，想為莫娘建壹座祠堂，得到了村裏人的同意。小氣自私的陸子貴也改變了態度，把林贖回怪魚的銀鎖還給了墨娘的嫂子。
墨娘只身闖入黑甲島，直奔海盜老巢。毒爪王打敗了莫娘，點了她的穴道。情況緊急，楊勝殺了全壹路。表現了東海四王子的形象。原來毒爪王是龜將軍。面對新老主人，他終於說服了郎利飛投降。見浪見勢不妙，暗器將龜將軍打倒，趁機從暗道逃走。
在蘭奕和三宅主人周淑麗的幫助下，墨娘解散了海盜，並鼓勵他們回到家鄉做安靜的平民。在清理財產時，我發現了海盜集團歷年來向知府王詩琪行賄的賬本。後來，墨娘將賬冊交給吳宗倫，吳宗倫大驚，趕到北京將賬冊轉交朝廷。
犰狳隱瞞不了，就把真相告訴了莫娘。為了避免兄弟自相殘殺的結局，他只能以楊聖泉的身份茍且偷生。回去的話會死在蠍子手裏，不知道怎麽辦。假楊聖泉的父母得知所謂的兒子其實是東海四王子，對他高貴的身份和超群的法力肅然起敬。他們不能再把他當兒子，而是恭恭敬敬地把他當祖宗。假楊聖泉覺得不僅不能孝順父母，反而給父母增加了負擔和壓力。很快，他留下壹封信，不辭而別。
莫娘的婚事成了全家人的壹塊心病，不斷有情人慕名而來。莫娘決心終身不娶，做觀音菩薩那樣的聖人。已經辭職回到莆田縣的吳宗倫，毅然向莫娘求婚，保證莫娘可以嫁人而不是嫁人，只做他名義上的妻子，同床異夢，以保全自己聖潔的身體，同時消除莫娘來自家庭和外界的壓力以及她無窮無盡的求婚煩惱。墨娘很感動，很快答應嫁給吳宗倫。
伢子和手下搞了幾次海難後，覺得小打小鬧殺人，不足以激起天庭的震怒，懲罰龍王。為了盡快奪取東海王位，他用了壹個新的致命招數向龍王表示孝敬，說要在無名島上為父親王建壹建造壹座陸地宮殿，有利於父親的健康安康。不明真相的龍王欣然接受。伢子帶領親信從海上掠奪大量漁民在無名島上建造宮殿，宮殿修好後所有建造者都葬身魚腹。然後他對天庭說，他要把這個罪歸罪於龍王，到時候他會因為立功而成為東海的新主人。隨即，他命令魔女嘉應和嘉佑帶領壹群蝦兵蟹將負責工程的建設，其余的手下跟著他在海上劫掠百姓。
很多漁民出海後就失蹤了，墨娘假扮成男人被故意帶到無名小島上強迫做苦役。她發現工地上有成千上萬的民工，還見到了許、盧三等鄰居和海盜寨主郎立飛。郎現已被嘉應和嘉友委派為監事。墨娘告訴村民們耐心等待，她會想辦法救他們回來。
墨娘深感這對假夫妻錯怪了吳宗倫，便有意撮合吳娶桂花為第二任妻子。但吳宗倫心裏只有莫娘，於是千方百計推脫，甚至編造了壹個假生辰來斷桂花的心。他高尚的品行讓莫娘既感動又愧疚。
吳宗倫把強盜島的證據交給朝廷，皇帝下詔將王詩琪下獄審問，命吳宗倫為全州知府。此時敵兵大舉入侵我邊境，皇上下令許大人率兵攻克。伢子得到消息，趁龍王不在，調集重兵進攻。墨娘接到信息後，立即飛赴海上營救漁民。在路上，她遇到了傷害漁民的龔燕。墨娘打敗了龔燕，但對方死死抱住她，告訴她如果救人會有危險。墨娘壹定不會相信，於是她把龔燕打倒在地，毅然決然地奔向出事的大海。經過壹番苦戰，墨娘救出了官船，卻在沙灘上被伢子及其爪牙圍攻。最終因為寡不敵眾，墨娘倒在了沙灘上。菩薩和大仙趕到時，她已是奄奄壹息...菩薩和大仙封印了墨娘的靈魂，大仙去玉帝那裏為她申請海神的稱號，卻遭到了四海龍王的反對。墨娘去世的消息震驚了四面八方的信徒，他們紛紛出資為她修建寺廟。香火直上九天，感動了玉帝和太後。最後他們同意加墨娘為海神和媽祖。
墨娘成為海神後，為了人民的利益更加努力。她先後制服了高麗鬼、龔燕，甚至外國摩爾斯等海怪鬼怪，教育他們化惡為善。將來，她會成為水雀仙班的壹員，幫助她確保海上的和平。這些邪神受到媽祖的啟發，改頭換面，逐漸改過自新，成為媽祖的臂膀。這時，我才知道是被水怪顏變成的，殺死了。他帶著孩子與苗渚壹起去監獄探望，並認王為父親。王死在獄中，經過壹番懺悔。
媽祖成為海神後，與吳宗倫交往頻繁，人間仙境攜手惠民。家鄉發生旱災時，媽祖親自向雨神求雨。沒想到，雨神壹直以為自己已經習慣了，甚至還調侃媽祖，保證不會壹直下雨。媽祖以自己的智慧，在玉帝面前使出渾身解數，逼著雨神為家鄉解決旱情，將萬代島改為墾區，安置外地災民，種植蔬菜解決災民燃眉之急，留下了菜子峪的名號和壹段佳話。
媽祖多次派手下前往無名島，查明壹夥人建造CCB宮的陰謀，並依靠太後的留聲機石獲取證據。最終伢子幫查出了和尚的下落，為了滅草，帶領手下追殺同胞兄弟。媽祖又來了，在危急關頭救了他。犰狳說他再也不回龍宮了，他要跟著媽祖去做壹件事。為了防止未名島項目的泄露，伢子唆使他的六個兄弟用無窮的力量將臺灣省島搬運到遠離大陸的地方。吳宗倫和媽祖合力打造天釘，牢牢綁住了金銀島。敵人被吳宗倫的軍隊逼退至下風島，用火炮反擊，使我軍處於劣勢。危急時刻，媽祖出現在敵線前方，用仁德之言擊退了敵軍將領，率部脫離了對我島的侵占。而吳宗倫在與入侵的敵兵英勇作戰的同時，最終中了敵人的箭，壯烈犧牲。
無名島宮殿落成當晚，亞子指示手下將所有民夫沈入大海。泄漏後，他還指使同夥沈入大海，民工相繼落水。媽祖壹方面帶領民眾營救他們，同時回到母親家，勸說父親和弟媳點亮房屋，以燈塔的作用指引落水難民。林家的義舉感動了村民，大家都努力幫助林家重建家園。
媽祖向玉帝告發了雅子侵犯他人的罪行，讓惡人受到了應有的懲罰。在人證物證面前，伢子壹夥是不可抵賴的，要受到天理的嚴懲。媽祖的水雀仙班成功建立，她繼續帶領部下在茫茫大海上巡邏。
吳宗倫被打造成抗敵英雄，媽祖也屢被封朝，事跡傳遍天下。