7月下旬，根據中央指示，新四軍蘇北指揮部成立，陳毅、粟裕分別任副指揮長，柳巖、鐘期光分別任政治部副主任。蘇北司令部下屬部隊改編為三個縱隊，九個團，約7000人。第壹縱隊司令員兼政治委員葉飛，下轄第壹、四、五團，第二縱隊司令員王必成，政治委員劉培善，第三縱隊司令員陶勇，政治委員劉先勝，下轄第三、七、八團。通過整編、統壹指揮、統壹建制，提高了軍隊的軍政素質，改變了軍隊面貌。
這時，中央東南局青年部長陳丕顯率領壹批幹部從江南來到蘇北，協助陳毅領導地方黨。從此蘇北局勢開始發生質變，與國民黨頑固派韓德勤的鬥爭從爭奪中間勢力進入對抗階段。
蘇北部隊整編後，第壹個問題是在哪裏建立根據地。當時有三個想法:壹是北進興化，二是守住原地，三是東進黃橋。蘇北本部權衡利弊，比較利弊後，認為興化是韓德勤統治的中心。在北方，興化違反自衛原則，地域狹小，糧食供應是個大問題。如果向外發展，必然會與發生沖突，不利於李與朝鮮的統壹。黃橋在靖江、如臯、泰縣、泰興四縣的中心。東面可發展到通儒、海齊地區，南面可控制長江。黃橋地區保安第四大隊何克謙勾結日偽，積極反* * *，分配賦稅，勒索錢財，作惡多端，長期失民心。所以第三種想法政治上合理，軍事上有利。
於是，蘇北指揮部立即向東部署，首先發出政治動員令，提出團結抗戰反頑口號，要求全體指戰員做好運動戰殲滅戰的充分準備。陳毅在連隊級以上幹部會議上說:這次只能贏，不能輸。我們正在破釜沈舟，進行最後的抵抗，我們再也不會回到西方了。他號召全體官兵下決心打贏。
7月25日，蘇北總部領兵東進。26日、27日經過兩個李扇區，兩個李尊嶽讓路。部隊朝天鳴槍以掩韓德勤耳目，新四軍則佯裝奪路。韓德勤發現新四軍正在東進，即使何克謙率保安四旅從黃橋及其以南地區向北進攻，他命令陳太雲稅警總團從瞿塘南向北新街地區進攻，南北夾擊，企圖消滅東進的新四軍部隊。
蘇北指揮部根據何克謙和陳太雲的不同情況，分別采取了應對措施。在打了兩個團，消滅了壹個營之後，陳泰運輸部把俘虜和槍支全部歸還，以示團結抗日。陳太雲表示願意與新四軍合作抗戰。對何部，蘇北指揮部部署第二縱隊占領黃橋東北的姜多、谷熹、郢西，第壹縱隊占領並貫通，切斷何可謙退路，第三縱隊攻占黃橋及其以南地區。28日，壹、二、三縱隊經過壹夜激戰，圓滿完成任務，殲滅任何部主力近2000人，爭取任何特勤團陳宗寶部起義。29日，新四軍占領黃橋。東進部隊攻克了靖江東北的孤山、西來鎮等日偽據點，俘虜偽軍40余人，粉碎了日偽兩次報復性掃蕩。
根據中央“穩步發展”蘇北的指示，新四軍進駐黃橋後，派出幹部、民運隊、服務團，配合地方黨組織發動群眾，積極建設抗日民主根據地。8月初，黃橋軍民聯合辦公室成立，以陳為蘇北司令部壹部兼縱隊政治部副主任，為辦公室主任，主持地方行政工作。
和戰爭後勤工作，恢復了黃橋周圍四個區的行政工作。8月下旬，通儒景泰臨時行政委員會成立，分別由關和陳任副主任，成員有、魏和薛漢陽，下設秘書處、行政部、財務部、文教部、軍事部、司法部和民主科。
同時，泰縣、泰興、如臯、靖江四縣政府成立，惠玉玉、陳、、任縣長。
9月中旬，根據中原局指示，成立了蘇中地區委員會，成員有:陳毅、粟裕、、陳丕顯、、葉飛、魏、吳、等，陳毅、陳丕顯為副書記。同時撤銷蘇北特委和江北特委。(1)成立泰興、如臯兩個中心縣委，泰興中心縣委書記魏領導江都、泰興、泰縣、靖江四縣工作；如臯中心縣委書記鐘敏領導如臯、南通、啟東、海門、崇明工作。
為了加速根據地的建設，準備反擊韓德勤的進攻，蘇北指揮部和新四軍軍部於8月20日發出了《關於創建黃橋根據地的指示》，強調指出:“當前的任務是:積極充實主力，嚴格訓練和鍛煉部隊，爭取群眾運動，奠定民主政權工作的基礎，準備迎接反掃蕩、反磨擦的勝利。”提出軍隊的訓練和發展、群眾運動、行政工作和黨的工作的具體方針和任務。此後，逐步開展了以黃橋為中心的根據地建設。
執委會頒布了抗日民主政策綱領、“二五減租”法令和群眾組織法。“二五減租”的口號壹提出，就在蘇北引起了社會反響。地主階級聽信了國民黨反動派的誣蔑宣傳，害怕“變相* * *生產”和“慢性* * *生產”；廣大農民希望執行當年紅十四軍的土地政策，擔心25日減租不是黨的真正政策。針對這些情況，黨政軍領導人壹邊以各種方式向農民和地主士紳解釋減租法，壹邊領導農民開展減租減息運動。大量農民從減租中受益。為廣開財源，保證供應，設立了黃橋、周家橋、丁家新、高家灣、廣陵鎮、邊街√下馬圍等7個稅務所，降低了稅率。8月中下旬稅收11萬元，9月份增加到21萬元，最高月份達到80萬元。
為了培養軍政幹部，成立了蘇北軍政幹部學校，吸收了大批知青。舉辦黨員培訓班，培養和提高新黨員。出版《抗敵報》(蘇北版)。建立農抗、婦抗、青抗等抗日群眾組織。新四軍加緊整訓，擴軍，8月新增新兵1200多人。建立的地方武裝組織有:景泰管委會200多人，如臯縣200多人，靖江縣100多人，泰興縣五六十人。有些區還成立了二三十人的地方武裝組織。這樣，以黃橋為中心的根據地建設已初具規模。