在保護生物學實踐中，保護措施對遺傳狀態有好的影響嗎？這需要對實施保護措施前後的基因數據進行比較。日本斑羚是野生動物保護實踐中非常著名的例子，從只有7只恢復到>:2000年，保護工作取得顯著成效。種群已經初步恢復的朱鹮的遺傳狀態也恢復了嗎？研究人員對朱鹮的歷史樣本和活著的個體進行了測序，並將歷史種群與活著的種群進行了比較。發現活種群已經失去了幾乎壹半的祖先種群多樣性，並且有非常嚴重的突變負荷。此外，研究人員還發現，伴隨近親繁殖的遺傳漂變在很大程度上消除了祖先多態性。
ABC圖中粉色表示活體樣本，其余為歷史樣本，NW表示西北，EA表示華東，NE表示東北地區；D圖中最右邊的樣本是活體樣本。活著的種群沒有明顯的種群結構，而歷史標本則表現出多樣性。
對這些人口的歷史動態進行了估算(PopSizeABC估算，過去10000年的變化比PSMC更近)，居住人口下降趨勢最明顯(註意時間從右到左)。研究人員模擬歷史生態位(ENMs)發現，進入末次冰期後，適合朱鹮生存的區域大大減少，這與進入冰期後種群數量減少是壹致的。圖B所示的當前適宜居住區域與上壹次冰期(圖C)基本壹致，這說明？19年末和20世紀初種群的崩潰更多是由於人類活動的影響，這與那個時期人類活動對棲息地的嚴重幹擾是壹致的。
與歷史樣本相比，活體個體的單核苷酸多態性很低，只有歷史群體的壹半左右。基因組中也有很多IBD，純合區域廣，說明近親繁殖嚴重。作者比較了朱鹮與其他物種的近親繁殖系數，發現存活種群的近親繁殖系數很高，即使與有效種群規模相近的其他物種相比，也是壹騎絕塵。
研究人員還研究了歷史種群和現在種群的等位基因頻譜，結果表明，隨著有效種群規模的急劇下降和嚴重的近親繁殖，現在種群中積累了許多有害的突變。這很可能是由於種群快速下降，凈化選擇去除已經來不及了。
環形圖顯示，生活群體的等位基因豐富度明顯低於歷史群體。在活著的人群中也有更多的長單倍型。
朱鹮瀕危是因為物種本身還是因為人為幹擾？這項研究的結果表明，朱鹮的種群數量本應在最後壹次冰期後的壹萬年內恢復，但卻未能恢復。這可能是因為朱鹮本身已經走到了物種的死胡同，人類活動的影響不容忽視。
雖然朱鹮的數量有所增加，但其基因組多樣性仍然非常脆弱，容易受到病原菌、環境變化等因素的影響。朱鹮的保護依然任重道遠。