英國航海家羅伯特·菲茨羅伊首先提出了澳大利亞土著人的起源問題。1839年，他認為澳大利亞和塔斯馬尼亞的土著是非洲黑人的後裔，或者是乘船時被風暴意外吹到這裏的，或者是逃跑的奴隸。就這樣，出現了關於澳大利亞土著起源的“非洲論”。這種說法顯然是毫無根據的，早就被考古資料和人類學、民族學、歷史語言學相關資料所駁斥。但是，他首次提出澳大利亞原住民是從大陸以外遷入的，這是正確的，也是有價值的。
1847年，英國人類學家波拉德認為，澳大利亞土著人的祖先最初是分布在大洋洲諸島的“黑人”，後來通過新幾內亞或帝汶到達澳大利亞大陸北岸，再逐漸擴散到大陸各地，從而產生了“黑人種族論”。
19世紀末20世紀初，兩位著名的人類學家——英國學者約翰·馬修(John Matthew)和哈維特(harwit)對澳大利亞土著的起源進行了深入的探討，得出了許多重要的結論。馬修認為澳大利亞土著是兩個或三個民族的混合體。他認為，澳大利亞土著最早的成分是生活在新幾內亞南部的巴布亞種族和與印度的達洛皮查人關系密切的種族。哈威繼承和發展了馬修的觀點，提出了澳大利亞土著人種族構成秩序的理論。
Harwit指出，澳大利亞土著是黑人種族和白人深色人種的混合體，先有黑人種族成分，後有白人深色人種成分；他還認為，今天印度的達洛皮查人也是高加索黑暗種族的後裔，斯裏蘭卡的維德人、日本的阿伊努人和印度的托達拉人仍與澳大利亞土著有血緣關系。
大約與哈爾維特同時期，德國學者格拉布納提出了澳大利亞土著起源的新理論，即所謂的“文化圈”或“文化層”理論。格拉伯納指出，今天的澳大利亞原住民中有四個不同的文化層或文化圈，這四種文化在不同時期從不同地區傳播到澳大利亞本土。
此後學者們壹直在不斷地討論這個問題。隨著科學技術的飛速發展，我們越來越接近澳大利亞土著人起源問題的答案。