到了明代，蓮花空前繁榮。明政府修建的萬裏長城穿過蓮花，重要關鎮北關就位於蓮花內。是海西女真葉赫部進京朝貢的交通要道，遺址至今仍存。明朝還在這裏開設了關市市場，與女真、蒙古等少數民族進行貿易，並以開閉市場作為控制各族恐嚇的手段。當時蓮花處叫棉花街，《奉天通誌》“鎮北關”篇記載“此地易以棉花為大宗，以滿足東北外族之需，故傳為‘棉花’。”花棉街後面有壹個蓮花泡。夏天，荷花盛開，成為當地的壹大美景。另外，棉花和荷花諧音。因此，花棉街後來改名為蓮花街，蓮花的名字壹直沿用至今。
清康熙二十年(1681)，開辟了從北京經奉天(沈陽)到船廠(吉林)的大郵路，並在花棉街設立驛站，稱為蒙羅站。康熙皇帝兩次東遊路過蓮花，留下了茶棚、歡喜嶺等地名和美麗傳說。
蓮花鎮冬季寒冷漫長，夏季炎熱短暫，春季溫暖幹燥，秋季清爽。降雨集中在夏季，雨熱同期，四季分明，是典型的溫帶大陸性季風氣候。這種氣候適合許多農作物的生長，主要農作物有玉米、水稻、高粱、大豆等；主要水果有山楂、蘋果、梨、杏。野生植物資源包括橡樹、菩提樹、楊樹、獼猴桃等。野生動物資源包括野雞、兔子、松鼠等。礦產資源包括花崗巖、石灰石和鐵礦石。優越的地理位置和豐富的自然資源為發展農村經濟提供了得天獨厚的條件。