學校現有15個教學單位，包括航海技術系、輪機工程系、汽車工程系、機械工程系、道路工程系、建築工程系、管理工程系、交通經濟系、安全技術與環境工程系、能源工程系、信息工程系、外語系、公共教育系、思想政治理論系、成人與繼續教育系。
學校積極依托行業企業，大力推進校企合作、工學結合，先後與國內外337家企業合作，培養高素質技術技能人才。雙方在課程建設、教材編寫、流程培訓、師資提升、技術支持、資金投入等方面開展了深度合作。
擴展數據:
福建航運交通職業學院的歷史沿革：
學校前身為中國近代第壹所官辦高等工業學校福建造船行政學校，創建於1866。
1949年9月，新中國成立後，稱:福建省高級航空機械商船學校。
8月，1952，全國部門調整，高航關閉；當年秋，航海專業並入國立福建海事專科學校，飛機、輪機、造船專業並入福建省福州工業學校。
1988年5月改為福建船政學校。1994年9月，遷至蒼山首山路辦學。
1994年福建船政學校遷至倉山，後並入福建交通職業技術學院。
2065 438+01 6月28日，福建交通職業技術學院更名為福建航運管理交通職業學院。
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