歷史演變:
1:特勤期
只有在北伐時期，國民政府才有情報組織。民國17年，蔣介石被任命為國民革命軍總司令。為了迅速平息亂局，他依靠可靠、靈活的軍政情報，於是在總司令部成立了“秘密調查團”，並專門任命戴笠負責北伐前線軍事情報的調查收集工作。這是第壹個情報組織。民國20年東北淪陷，二八事變21年日軍入侵上海。民國二十壹年三月，蔣介石召開高級軍事會議，決定組織情報網，收集偵查資料，研究國內外形勢，作為抵禦外侮、穩定國家的參考。於是，4月1日成立了“特務機關”，同年9月，軍委成立了調查統計局，特務機關奉命劃歸其管轄，改名為該局二科，負責情報和訓練。
2.軍統時期
民國26年，全面抗日戰爭展開。在國民政府長期抗戰的政策下，戰區越來越廣，情報工作越來越重要。特務機關奉命擴大為軍委調查統計局，由軍委高級軍官兼任局長，戴笠任副局長，負實際責任。
3.保密局時期
抗戰勝利後，國民政府於1935年5月回到南京，撤銷軍委，成立國防部。同年8月，軍統局奉命改組為國防部保密局，負責保密和防止間諜活動，確保國家安全。1939年6月，國防部保密局奉命恢復保密局的正式組織，並將總部設在臺北市獅嶺山彥，以持續執行國內安全及情報搜集的重任
4:情報機構時期
1944年，情報局改組，任務重新劃分。保密局奉命改組為國防部情報局，原來的安全防衛調查由司法行政部調查局接管。此後，該局負責戰略預警信息的收集和研究。
5:軍事情報局時期
1974年7月1日，原情報局奉命與國防部特別情報處合並，組建軍事情報局，隸屬於國家。
國防部參謀總部由參謀長直接指揮。