歷史原因是openjdk是jdk的開源版本，以GPL協議的形式發布。JDK7的時候，openjdk已經成為jdk7的骨幹開發。sun jdk7是在openjdk7的基礎上發布的，大部分源代碼都是壹樣的，只有少部分被替換了。使用JRL(Java search許可證)發布。
至於openjdk6，就比較復雜了。首先，openjdk6是jdk7的壹個分支，盡可能去掉了Java SE7的新特性，使其盡可能符合Java6的標準。
JDK和OpenJDK之間的差異可以總結如下:
不同的許可協議:
Openjdk是由GPL V2協議發布的，而jdk是由JRL發布的。雖然這兩個協議都是開源的，但使用上的區別是GPL V2允許用於商業用途，而JRL只允許用於個人研究。
OpenJDK不包括部署功能:
部署的功能有:瀏覽器插件、Java Web Start、Java控制面板，這些都是Openjdk中沒有的。
OpenJDK源代碼不完整:
我們很容易想到，在采用GPL協議的Openjdk中，sun jdk的部分源代碼因為產權問題不能被openjdk使用，而最重要的部分是JMX可選組件SNMP的代碼。所以這些非開源代碼讓它plug for OpenJDK編譯，也可以選擇不使用plug。Icedtea為這些不完整的部分開發了相同的函數源代碼(OpenJDK6)，使得OpenJDK更加完整。
部分源代碼被開源代碼取代:
由於產權問題，很多產權不是SUN的源代碼被壹些功能相同的開源代碼代替，比如字體光柵化器，用Free Type代替。
Openjdk只包含最簡單的jdk:
OpenJDK不包含其他軟件包，如Rhino Java DB JAXP……...而且能分開的軟件包也盡量分開，不過大部分都是免費軟件，妳可以自己下載加入。
妳不能使用Java商標:
這個很好理解。在安裝openjdk的機器上，鍵入“java -version”顯示openjdk，但如果是帶有Icedtea補丁的openjdk，則顯示java。(未驗證)
總之，在Java系統中，還有很多元素是不自由的，源代碼的開發也不夠徹底。我希望Oracle能讓JCP變得更加自由和開放，這是所有Java社區所希望的。