二是轉變觀念提高認識。由於行政事業單位不具生產功能的特殊性，不少部門領導對內部審計抱著可有可無的態度，特別是近幾年部門預算、國庫集中支付、政府采購等壹系列公***財政體制的逐步推行，部分領導更是覺得內部審計是大可不必。正是這種認識上的錯位影響了內審工作的順利發展。實際上，發展和完善行政事業單位內部審計，是強化政府有效治理的客觀需求。行政事業單位的目標是在壹定的經費保障下履行國家賦予的公***管理職能。這個目標能否有效實現在很大程度上取決於單位是否具備良好的控制環境，而內部審計正是行政事業單位改善內部控制，加強內部監督的有效手段。通過內部審計對單位的風險、控制進行經常性審查、分析和評估，可以反映行政事業單位資金使用效益的現實水平，從而提出改進建議，不斷提高行政事業單位內控制度的科學性，保證組織目標的實現。所以要多渠道、多角度地宣傳內部審計價值，通過內部審計專題培訓等途徑提高行政事業單位領導和幹部職工對內部審計的認識。
三是逐步完善內部審計機構的設置。機構的不健全和人員的不到位使內審工作常常只能紙上談兵。近年來，審計部門對行政事業單位預算執行審計中所發現的大量違規問題，從壹定程度上說正是內部審計沒有充分發揮作用的有力證明。當然，在目前行政事業單位內部審計發展的初步階段，不能強求所有單位壹步到位地解決獨立內審機構的設置問題，但應該從實際情況出發，在保證行業行政主管部門設置獨立內審機構的基礎上，循序漸進，逐步完善內部審計機構和人員的配備，成立與財務、紀檢監察部門分離的、受單位主要負責人直接領導的內審機構。
四是實踐內審工作新理念。目前行政事業單位的內部審計基本局限於對單位財務真實性、合規性的事後審查，往往在壹既成事項上繞圈子，而鮮有對資金效益、管理漏洞、制度健全等方面的有效評價。中國內審協會現已提出內部審計要由以財務審計為主向以財務審計和風險控制為導向的管理審計並重為主的新理念，要求內審工作做到重監督也重服務，重結果也重過程。