2020年5月下旬，電子港口出口退稅模塊退出歷史舞臺。新平臺出口退稅網絡檢查系統已正式使用。使用新系統進行出口退稅的過程如下：
1.登錄電子口岸執法系統(網站：chinaport.gov.cn)，在業務系統向下選擇出口退稅在線檢查模塊；
2.電子港IC卡信息登錄系統；
3.選擇出口收匯選項，點擊口岸備案紙質核銷單；
4.辦理報關手續，填寫稅務局領取的出口商品專用發票；
5.通過出口退稅申報軟件輸入並打印兩份數據，分別提交外匯局和出口單位；
6.通過電子港口執法系統選擇進出口收匯選項進行企業交單；
7.打印出口收匯核銷信息登記表，進行網上核銷申報；
8.工行出口收匯核銷提供收回日期和核銷金額；
9.向外匯局提供核銷單.報關單.工行蓋章核銷單.出口收匯批次核銷信息登記表及電子口岸IC卡，辦理收回核銷；
10.通過網上稅務申報系統輸入報表和納稅申報表；
11.將出口貨物退稅申報系統中的免稅數據上傳至稅務局網站；
12.退稅申報系統將出口貨物退(免)稅，申報成功後存入U盤備份；
13.等待稅務局審核出口退稅材料；
14.接到稅務局通知後，攜帶退稅批準。公司公章，印章到稅務局辦理退稅申請手續；
15.辦理退稅手續後，銀行將在壹周內從國家金庫撥入公司賬戶，完成出口退稅。