遊戲是自動存檔；從關卡退出到地圖，遊戲會自動記錄臨時記錄，返回可以繼續進行，不過動物會默認初始狀態，水井和工廠默認退出時狀態。
從地圖退出，遊戲會自動存儲進程紀錄。遊戲只要是正常退出，重新開啟時都可以繼續上次的進程。
存檔默認在c:\Documents and Settings\All Users\Application Data\FarmFrenzy3\
如果不想要以前紀錄，刪除文件夾內文件或刪除文件夾，然後運行遊戲，遊戲會重新設置文件夾和文件。
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