1989年3月，國家核安全局北京核安全中心成立，為國家核安全局直屬事業單位。人員編制50人。
1993年12月，由國家科學技術委員會（簡稱國家科委）歸口管理更名為國家科學技術委員會核安全中心。人員編制100人。
1998年3月，國務院機構改革中心轉隸國家環保總局，成為國家環保總局直屬事業單位，更名為國家環境保護總局核安全中心。人員編制100人。
2006年3月，更名為國家環境保護總局核與輻射安全中心。人員編制100人。
2008年10月，更名為環境保護部核與輻射安全中心。人員編制170人。
2010年2月，擴編並加掛“環境保護部核安全設備監管技術中心”牌子。人員編制600人。