在藥廠的平面內，並不都是生產車間，也不都是潔凈區。
根據WHO的GMP，藥廠廠房平面內可以分以下幾個區：
生產區——直接從事藥品生產的區域，有潔凈度要求。
質量控制區——設有質量控制實驗室、檢定室、儀器儀表室等，有潔凈度要求。
貯存區——存放各類物料和產品，
物料：如起始原料、包裝材料}
產品；如中間產品、待包裝材料和成品、待驗產品、合格產品、不合格產品、再加工產品、回收產品。
有壹定的溫濕度和潔凈度要求，特別要註意高活性物料、麻醉品，有誤用危險的藥物以及需防火防爆的物品的特殊存放要求。
稱量區——對起始原料的稱量，有壹定潔凈度要求或塵埃控制要求。可以放在儲存區內。
輔助區——包括更衣、存衣、洗衣、盥洗、休息、維修和動物房。除動物房和二更、洗衣外，
壹般無潔凈要求。
GMP(2010)對藥廠平面明確分為生產區、倉儲區、質量控制區和輔助區。其具體內容和WHO GMP的規定略有不同：
生產區中含貯存區（不同於倉儲區）、稱量室、包裝區、中間控制區。倉儲區中含物料取樣區。質量控制區中除含有各種實驗室、儀器室外，還包臺實驗動物房。輔助區除不舍動物房外，和WHO的GMP相似。或者，接對空氣潔凈度要求的程度，將平面劃分三個區：
在上述前兩個區內，只應設置必要的工藝設備，盡量減少潔凈面積，控制層商，以降低投資和能耗。