內部控制評價流程，就是內部控制評價工作從開始到結束的基本過程。國際上權威的觀點認為評價壹個內部控制體系本身就是壹個過程，在這個過程中應有壹套規程以及其壹些內在的基本要素。內部控制評價流程到底包括哪些基本要素，在理論界和實務界認識是不同的，做法也是不壹樣的，也因評價主體和內容的不同而不同。管理層自我評估和審計機構評價流程會略有不同。基於財務報告內部控制評價和基於全面內部控制評價的流程也不可能完全壹樣。我國《企業內部控制評價指引》要求企業應當按照內部控制評價辦法規定的程序，有序開展內部控制評價。內部控制評價程序壹般包括：制定評價工作方案、組成評價工作組、實施現場測試、認定控制缺陷、匯總評價結果、編報評價報告等環節。這是我國企業內部控制評價工作的法定程序，是必須要執行的最基本的程序。中天恒3C框架把內部控制評價流程分為評價準備、評價實施、評價報告三個階段，每個階段又可細分若幹內容。
企業應當根據內部控制評價結果和整改情況，編制內部控制評價報告。內部控制評價報告至少應當包括下列內容：
（1）組織實施內部控制評價的總體情況；
（2）內部控制責任主體的聲明；
（3）內部控制評價的範圍和內容；
（4）內部控制評價的標準和依據；
（5）內部控制評價的程序和方法；
（6）內部控制重大缺陷及其認定情況；
（7）內部控制重大缺陷的整改措施及責任追究情況；
（8）內部控制有效性的結論；
存在壹個或多個內部控制重大缺陷的，應當作出內部控制無效的結論。
《深圳證券交易所上市公司內部控制指引》自我評價報告至少應包括以下內容：
（1）對照本指引及有關規定，說明公司內部控制制度是否建立健全和有效運行，是否存在缺陷；
（2）說明本指引重點關註的控制活動的自查和評估情況；
（3）說明內部控制缺陷和異常事項的改進措施（如適用）；
（4）說明上壹年度的內部控制缺陷及異常事項的改善進展情況（如適用）
《上海證券交易所上市公司內部控制指引》公司內部控制自我評估報告至少應包括如下內容：
（1）內控制度是否建立健全；
（2）內控制度是否有效實施；
（3）內部控制檢查監督工作的情況；
（4）內控制度及其實施過程中出現的重大風險及其處理情況；
（5）對本年度內部控制檢查監督工作計劃完成情況的評價；
（6）完善內控制度的有關措施；
（7）下壹年度內部控制有關工作計劃