福州十六中是壹所具有深厚歷史底蘊和優良傳統的百年名校。90年代，以鮮明的辦學特色、獨特的文化品位、良好的教育質量，榮獲“福建省文明學校”、“福建省先進教育單位”等榮譽稱號，受到國家副總理等領導的視察和表揚。
學校學生還在國家級、省級、市級學科競賽中取得優異成績。曾獲“華杯”全國數學邀請賽壹等獎、全國信息學奧林匹克競賽各省壹等獎、全國初中應用物理知識競賽二、三等獎、全國初中生化學素質與實驗能力競賽二、三等獎、機器人大賽壹等獎、市青少年科技創新大賽壹、二、三等獎。福州市中小學生獲得合唱節比賽壹等獎，中小學生運動會總分六連冠，中小學生排球比賽八連冠。畢業生薛辰在北京奧運會上為中國隊贏得了女子沙灘排球的銅牌。