性功能是男性陰莖的正常生理功能。男性受到性刺激時，陰莖神經興奮，使陰莖海綿體內的大量血液流入海綿體，從而使陰莖勃起。陰莖勃起是由神經和血管的反射引起的。許多男性都有勃起功能障礙，這是最常見的男性性功能障礙之壹。男性勃起功能障礙的常見原因是海綿體供血不足。這種情況的治療壹般是改善海綿體的血液供應，增加勃起時的血液供應，從而改善男性勃起的硬度和持續時間。目前可以用藥物進行治療，如西地那非、他達拉非；以及外用藥物，如前列腺素E1乳膏等。
男性陰莖勃起後進入陰道3分鐘以上才射精是正常的。如果少於3分鐘，則為早泄或勃起功能障礙。如果男性長期沒有性生活或自慰，可能是性生活時陰莖敏感度過高，導致勃起時間不足3分鐘，屬於正常現象，並非病理狀態。勃起時間的長短與個人體質、種族、飲食有關。建議及時到正規醫院的泌尿外科或生殖科進行常規精液分析、陰莖血流圖測量和海綿體動靜脈壓檢查。根據檢查結果明確病因和疾病診斷，然後積極進行治療，以免對生殖功能和夫妻感情造成不良影響。