清光緒二十八年(公元1902年)，改建為林三書院。清光緒三十三年(公元1907年)改為“林三高級中學”。民國元年(公元1912)，校舍毀於大火。校長秦希天(秦榮光之子)和督學趙苦心籌劃，重修新樓，改名為、和鄉高級中學，並與鄉的四所小學合並，設置學校的管理機構為秦的聯合負責人。民國十五年(公元1926年)，楊司劃為市區，故改名為“私立林三小學”。民國十九年(公元1930年)，校長秦希天與校長丁籌劃成立中學部，原名“私立職業中學”，首任校長為丁。次年，學校更名為“私立林三初級商業職業學校”。民國二十六年(公元1937年)“八·壹三事變”後，日軍強占領土，學校遷至上海租界愛文壹路(今北京西路與黃河交匯處)平和裏44號，並設高中業務部。民國三十年(公元1941年)5438+02年6月太平洋戰爭爆發，日軍侵占租界，校董事會決定宣布中學停辦。石的原校址是日據時期的“上海第四中學”。抗日戰爭勝利後，學校於民國三十五年(公元1946年)二月遷回林三鎮原址，正式復課。由於學校設備已被毀壞，它被改為壹所普通中學，並增加了壹個高中班，命名為“私立林三中學”。
1950秋季學校新增電信、機械招收本校及松江區初中畢業生。1953 65438+10月，學校改為公辦，更名為“上海市林三中學”。9月，1958，市區曉光中學5個高中班與老師合並在壹起。65438-0965在市區招生，接受上海市高中寄宿生。“文革”始於1966，教學設施遭到嚴重破壞。粉碎“四人幫”後，政府撥出巨資維修和修建校舍。1978 65438+10月，學校被列為上海縣重點中學。1993從上海縣轉到浦東新區，現在是浦東新區重點中學。
1992年學校被當時的上海市教育局命名為“上海市第壹階段課程教材改革試點單位”，1999年被上海市教委命名為“上海市第二階段課程教材改革實驗基地”。