1942之前，閩南僑鄉惠南沒有中學。小學生進入初中，要翻山越海進入城市，路途遙遠，費用昂貴，又不方便，所以貧困家庭的孩子失學的不在少數。村民們希望惠南地區能有壹所中學，方便他們的孩子學習和發展教育。
1943年，熱心教育事業的羅忠信先生和孫中基先生利用東園西山小學的部分校舍創辦了復興中學，壹年後因種種原因並入惠安中學。
1945抗日戰爭勝利後，海外華人與家鄉的聯系日益緊密。65438年4月至0946年4月，菲律賓愛國華僑教育家黃泰南先生等鄉鎮領導發起並組織了惠南中學籌備委員會，後改為菲律賓惠南中學董事會。1947年5月，黃泰南先生親自回國，在廈門成立惠南中學董事會，開始籌建學校。學校命名為“惠安私立惠南初級中學”，聘請羅先生為校長，先生為教務主任。黃泰南先生選擇大覺山南麓的靈光寶地作為新校址，準備興建校舍。同時，東園西山小學部分校舍用於8月招生，9月開學。從此，惠安縣第壹所華僑辦中學誕生了。後來，黃泰南先生回到南洋各港口收錢。在熱心群眾的支持下，於1948年春開工建設“喬菲館”，次年夏竣工，秋季遷至現址。
惠安解放後，人民政府接管了學校，學校仍屬僑辦，面向全縣招生。1954年，為加強黨對學校的領導，惠安縣委、縣政府派黨員劉晉元到學校。同年，黃泰南先生從菲律賓回到家鄉，回到自己創辦的惠南中學，次年出任校長。
黃泰南先生主持學校行政工作後，發揚“簡樸、勤奮”的校訓，與大海溝通，廣泛聯系海外僑胞和港澳臺同胞，多方籌措資金，籌建教室、禮堂、發電廠等校舍，購置圖書、儀器等設備設施，改善辦學條件。1958年秋，校舍初具規模，增加了壹所高中。惠南中學成為惠安縣南部唯壹壹所完全中學，教育質量越來越高，名氣越來越大。後來被稱為惠安縣四大老中學之壹。
“文革”期間，學校教育秩序遭到破壞，更名為“惠安縣東源人民中學”。1978後，學校更名為“福建省惠安惠南中學”。
1982，莊先生任校長時，改組校董事會，羅先生任董事長兼名譽校長。洛法先生、歷任主席及全體董事開展了卓有成效的工作，為改善辦學條件做出了積極貢獻。
1997期間，惠南中學舉辦50周年校慶活動，受到縣委、縣政府的高度重視，被納入惠安縣“慶壹節、慶兩慶”統壹活動，成為全縣人民政治生活中的壹件大事。省、市、縣相關領導，以及部分華僑親屬、鄉鎮領導、海內外校友參加了校慶大會，不僅擴大了學校的影響力，也提高了學校的知名度。
從65438到0998，在政府的重視、社會的支持和師生的努力下，學校順利通過了省教委“三級標準中學”的驗收，從而步入了重點中學的行列。
65438年至0999年，羅炳輝同誌任書記、校長時，為了危房改造，改變學校原有區域布局不合理，率先重新規劃校園，進入新壹輪創業。在僑眷、校友、鄉賢的全力支持下，拆除了危房，修建了教學樓、師生食堂、園丁樓、學生公寓、行政辦公、實驗綜合樓等校舍，並開設了400米田徑運動場。到2004年秋，分階段進行的五年校園改造基本完成，學校面貌煥然壹新，辦學條件更是上了壹層樓。
2004年秋，王宏慶同誌任書記、校長時，經過多方努力和協調，學校的《關於撥專款在輝南中學與上侖村之間鋪路的提案》被列入我縣十壹屆CPPCC二次會議第54號提案，受到縣委、縣政府的高度重視。該項目於2005年至2007年被列入該縣自然村公路通達項目庫，計劃於2006年建成通車。
2005年4月，第六屆校董事會隆重成立，董事長為校友、企業家黃俊誌先生。成立大會當天，鄉賢和校友們表現出極大的熱情，踴躍捐款建言，為學校獎學金活動的開展提供了堅強的後盾。校董會已經成為辦學的重要支撐力量。
在社會各界的支持和全體師生的共同努力下，學校於2005年5月25日高分通過省級“二級標準中學”驗收，並於2006年2月13日由省教育廳正式確認並授牌。學校的規範推進為今後的進壹步發展奠定了新的更高的起點，各項工作也逐漸進入發展的快車道。
建校60年來，教師生活提高，* *培養了2萬多名初高中學生，其中有許多卓有成就的教授、研究人員、黨政軍各級領導、實業家，還有壹大批活躍在各行各業的勞動模範和骨幹人才...可謂“桃李滿天下，人才遍地”。
“以質量求生存，以特色創壹流”是惠南中學永恒的主題。今天，惠南人遵循“樸實、勤奮”的校訓，圍繞惠南中學“十壹五”教育規劃，堅持“以人為本、合作競爭、可持續發展”的管理理念，遵循“以人為本、以德治校、特色建校、科研興校、管理強”的原則，壹手抓洋樹形象，為學校的可持續發展奠定基礎、鋪平道路。力爭通過五年的不懈努力，提升內涵，特色辦學，科學發展，把惠南中學建設成為福建省具有壹定影響力的壹流學校。