在中國的沿海地區，在臺灣海峽兩岸，在華僑居住的碼頭上，都修建了供奉媽祖的廟宇。僅臺灣省就有3000多座供奉媽祖的寺廟，信眾超過14萬人。香火之盛，天下之冠。尤其是大部分寺廟都是直接從“梅州祠堂”中分出的，當地人以此為榮。每年的媽祖聖誕節，來自臺灣省各地的代表團經常到海對岸的湄洲島的祖廟朝聖。
媽祖是臺灣海峽兩岸同胞信仰的海神。早在明熹宗天啟四年(1624)，居住在日本的嚴思齊等人就想推翻幕府。不料嚴思齊、鄭誌龍等28人只進了13艘船，就逃到臺灣省的蠢港(今新港)安營紮寨，開發寶島。後來，在本鋼西區建立了天妃寺。媽祖宮，創建於本剛炎、鄭時期，稱為“開基媽祖”，代代擴建，規模壯觀。
清順治四年(1647)，荷蘭殖民統治時期，福建移民在鹿港碼頭附近修建了壹座媽祖廟，史稱“鹿仔港天寺”。每年媽祖生日，按照大陸的做法，都會舉行隆重的儀式。
鄭成功收復臺灣省後，漳州、泉州、徽州、潮汕等地的人去臺灣省，都是把“湄洲祖廟”的神像或香火帶上船。上岸定居後，他們除了擴建“鹿仔崗天寺”外，還在保留地上另建了壹座寺廟供奉媽祖。因梅州供奉媽祖神像，祠堂名曰“天後宮”。
清康熙三十三年(1694)，大陸僧人樹墻從湄洲祖廟朝天閣渡海至雲林北港，張泉當地移民隨即集資修建媽祖廟，留下樹墻主持香火。後來擴建為“北港朝天宮”。現在已經成為臺灣省香火最高的寺廟。
清光緒二十壹年(1895)，甲午中日甲午戰爭，清軍戰敗，臺灣省同胞在日本侵略者的壓迫下，仍不忘祭拜媽祖，表現了關愛親人、緬懷祖先的情懷。臺灣省的媽祖廟增加了而不是減少了。
清光緒二十六年(1900)，孫中山策劃臺灣省徽州起義，結識梁啟超，壹起拜天後宮。此時的兩個廣東老鄉，壹個為“國民革命”奔走，壹個為“戊戌變法”逃亡，立場不同，境遇不同，但他們熱愛自己的國家，熱愛自己的家鄉。異地相逢，真好。梁欣然為慈悲為懷的“護海神”媽祖搖手，並題寫對聯:“顯神通四海，永垂不朽；歷經幾朝，幾代封。”寫得好，以唱代唱，為媽祖信仰在臺灣省的傳播又增添了壹個故事。
現在，臺灣省兩岸雖然隔離了壹段時間，但海峽兩岸同胞對媽祖的尊重並沒有因為暫時的隔離而中斷，臺灣省各地的媽祖廟壹直在增加。近年來，臺灣省和媽祖廟都組織了前往“湄洲祖廟”祭祖的活動。近年來，每年都有超過10萬名臺灣香客前往湄洲島朝聖。