1951回國後，先在大連工學院任教授，1952年調入張家口解放軍通信工程學院(現西安電子科技大學)教微波電子管。1956年參加國務院直接組織的國家中長期科研規劃12，後調入交通部科學研究院任研究員。1957參與第二機械工業部12研究所(現北京真空電子技術研究所)的籌建工作。12，歷任研究室主任、副總工程師甚至高級技術顧問。1984年電子轉部新建電子工業出版社任主編，為電子工業出版社的發展做出了新的貢獻，直至1996年退休。
吳紅石壹直熱心於各種學術活動。歷任國務院學位委員會物理電子學與光學第壹評審組成員，國家科委發明評選委員會電子學與儀器第壹評審組成員，國家科委全國科技術語審查委員會第壹委員並主持電子術語審定工作，中國翻譯工作者協會常務理事。中國電子學會常務理事，第二屆出版委員會主任委員，《電子學報》和《中國電子學報》執行編委、副總編輯，《應用科學學報》副總編輯。
吳紅石對教育情有獨鐘，尤其是學校教學和高級人才的培養。先後在清華大學、南京理工大學(現東南大學)、上海科技大學(現上海大學)、山東理工大學擔任客座教授，在西安電子科技大學長期兼職教授、博士生導師，開創了物理電子學、光學博士點。也是北京信息科技大學的長期兼職教授，主要培養物理學和電子學方面的博士生。