上帝讓諾亞用歌斐木造壹艘方舟，並教諾亞船的規格和構造。之後，諾亞壹邊催促世人悔改，壹邊趕著建造方舟。諾亞獨自花了120年，終於建造了壹艘巨大的方舟。他聽從神的話，動了壹家八口，各種飛禽走獸成雙成對，有條不紊地進入方舟。7天後，洪水從天而降，持續了40個晝夜，所有的人和動植物都陷入了無底的災難。除了諾亞壹家，亞當和夏娃的後代都被洪水吞噬了，就連世界上最高的山也低於水面7米。
神看顧挪亞和方舟裏的飛禽走獸，就命雨停，風生浪，風把水吹起，水漸漸退去。諾亞方舟停靠在阿拉拉特山的邊緣。幾天後，諾亞打開方舟的窗戶，放出壹只烏鴉去探聽消息，但那只烏鴉再也沒有回來。諾亞又放了壹只鴿子，讓它看看地上的水是否退去了。因為到處都是水，鴿子找不到落腳的地方，飛回方舟。七天後，諾亞再次放飛了鴿子。黃昏時分，鴿子叼著橄欖葉飛了回來，顯然是從樹上啄下來的。挪亞由此判斷，地上的水已經退了。後人用鴿子和橄欖枝象征和平。
這就是諾亞方舟故事的由來。雖然是傳說，但聖經中記載的很多事情都被證明是真的。比如在壹次戰爭中，壹名軍官根據《聖經》中的記載，成功地在山裏找到了壹條秘道，並通過這條小路突然出現在敵人面前，大獲全勝。如果能證明諾亞方舟也是真的，那麽這個發現壹定會在全世界引起轟動。因此，多少年來，許多國家的聖經考古學家都希望揭開這個永恒的謎。