2004年，以當時在園藝系工作的王英強副教授為第壹作者的論文《壹種新的自花授粉機制——花粉滑落》在國際權威學術期刊《自然》上發表，實現了廣東學術界發表論文的突破。
學校在水肥保持技術、水禽健康養殖、花生育種、獼猴桃、鷹嘴豆、藍莓、銀杏等優良珍稀水果培育、甜糯玉米雜交利用、病蟲害防治、嶺南特色農產品加工、觀賞花卉、草坪草種植、行業和地方標準制定、農林產業規劃等方面取得了壹批重大科研成果，產生了顯著的經濟效益和社會效益。圖書館
學校圖書館藏書1.55萬冊，電子圖書320萬冊，各類數字資源庫18個。擁有完善的現代化電子書系統和計算機網絡服務系統。
學術期刊
《仲愷農業工程大學學報》是由仲愷農業工程大學主辦的自然科學學術期刊，創辦於1988。截止2013年底，該刊現為:新聞出版總署、中國期刊網、中國學術期刊(光盤版)、萬芳數據-數字期刊群、中國核心期刊(精選)數據庫、中國農業文摘-植物保護、等收錄的期刊。