《彼得大帝》第壹集的劇場版，其中女主角是小霞。
1998:超夢逆襲。講述了壹個火箭科學家根據神奇寶貝“夢”的睫毛克隆出壹個基因神奇寶貝的故事。它能力很強，號稱是最好的神奇寶貝大師。它從火箭中逃脫後，在壹個島上克隆了壹批克隆的神奇寶貝。後來挑戰了很多神奇寶貝家庭，遇到了小智壹行...
註:98劇場版有專門的續集，壹般不計入劇場版。這部特別的續集壹般叫《超夢，我在這裏》，或者叫《超夢再現》，講述的是肖誌和他的當事人再次遇見超夢的故事。
1999:Logia的生日。講述了瘋狂的收藏家吉爾·魯泰夫人為了引出傳說中的海神，而捕獲了火神、冰神、雷神三只神奇寶貝，正巧遇到了小智壹行，故事就此展開...
2000年:結晶塔皇帝。講的是壹個叫小美的女孩。因為她醫生的父親在她發現“未知圖騰”的時候失蹤了，所以她遇到了神奇寶貝的“未知圖騰”。因為小美的願望，那個不知名的圖騰逐漸把她的房子變成了結晶塔，“顏地”就是小美父親的化身。因為小美渴望媽媽，“顏地”把小智的媽媽抓進了結晶塔，小智無法置身事外。
2001:雪拉比穿越時空的經歷。這是關於40年前的壹片大森林。壹個叫小雨的男孩想去森林裏畫畫。在森林裏，小雨遇到了被神奇寶貝獵人追趕並受了重傷的雪拉比。當他們被神奇寶貝獵人逼得走投無路時，雪拉比在40年後(也就是現代)帶著小雨去了森林。碰巧小智他們就在這片森林裏。他們救了小雨。小雨把雪拉比的事告訴了小智，小智救了雪拉比。
2002年:水之都的贊助人，拉迪亞斯和拉迪奧斯。這壹次，傳奇從圖書館的小偷開始...大盜桑蘭和裏奧來到水都尋找拉狄亞斯和拉狄亞斯，小智壹行也來到水都，在挑戰城盟的路上遇到了拉狄亞斯，故事就這樣開始了...
寵物小精靈第二超時代版(AG)的劇場版，女主角是梅。
2003年:許願星的七夜。立誌成為優秀神奇寶貝訓練師的小智、梅和鄭瀟，帶著皮卡丘開始了新的旅程。為了觀看千年彗星的出現，我來到了Enes遊樂園，遇到了魔術師巴特勒和黛安。在魔術表演過程中，鄭瀟聽到了壹種微妙的呼喚，那是神奇寶貝基拉奇的呼喚...
2004年:瘋狂的訪客:代歐奇希斯。為了調查生活在冰原上的神奇寶貝，科學家隆多博士帶著兒子小超和助手段麗陽前往極地。突然，壹顆從遙遠的宇宙飛來的隕石擊中了地表。神奇寶貝代歐奇希斯從火山口出現了！它撿起了壹塊內部發出綠光的隕石，在研究它的時候，天空中出現了神奇寶貝烈空坐的身影。認為代歐奇希斯是入侵者的烈空坐二話沒說，給了他壹道死亡射線，整個冰原頓時變成了壹個大打出手的戰場！四年後...帶著挑戰豐原聯盟的目標，他們繼續前往肖誌、梅、小崗和蕭聲，他們來到了科學極其發達、壹切都電腦化管理的高科技城市拉盧斯(順帶壹提，這是梅的宿敵德魯的家鄉)。小智和皮卡丘要挑戰城市中最壯觀的建築——戰鬥塔。正準備打壹場神奇寶貝大戰的小智，碰巧遇到了壹個少年，那就是小超。四年前他目睹的恐怖經歷讓他精神受到創傷，無法觸摸神奇寶貝。得知此事後，肖誌壹行想幫助肖超打開他封閉已久的心扉。就在他們試圖讓小超克服恐懼的時候，突然，消失了四年的代歐奇希斯又出現了！肖誌壹行和肖超再次體會到了截然不同的奇妙經歷和驚險冒險...
2005年:盧卡裏歐，夢想和波導的勇敢者。遠行的小智皮卡丘壹行來到了流傳著“鳥的傳說”的歐魯德朗鎮。在市中心，為幾百年前的“波導勇者阿郎”舉行了儀式。小智和皮卡丘決定參加今年的勇鬥。經過激烈的戰鬥，獲得冠軍的肖誌當選為當年的“鳥之勇者”。城裏舉行了盛大的宴會來慶祝獲勝者。突然神奇的神奇寶貝“夢”出現了。然而，夢想隨著皮卡丘消失了。與此同時，“神奇寶貝”和“Lucario”幾百年前的封印被打破，身影出現在小智面前。
2006年:海洋王子馬納菲。為了稱霸開發區，壹直在官渡旅遊的小智、五月、小剛和鄭瀟認識了廣美壹家和在某鎮以神奇寶貝表演聞名的精靈遊俠傑姬。傑基這次的任務是護送神奇寶貝馬納菲的蛋，把它們送到海之神殿，水之子民的神殿。被稱為“歌劇魅影”的海盜船長為了得到海之神殿的海之王冠，搶走了馬納菲的蛋。與此同時，火箭隊也來分壹杯羹，壹場保衛海洋王子馬納菲的征程開始了...
寵物精靈第三部鉆石&；劇場版的《珍珠》，女主角是小光。
2007年:決戰時空之塔:帝牙盧卡VS帕魯西亞VS夢魘神。為了參加接下來的神奇寶貝華麗大賽，小智、小光和小剛來到了阿拉莫斯鎮。他們在鎮上遇到了壹個名叫愛麗絲的漂亮女孩。愛麗絲帶大家參觀了這裏的標誌性建築——時空之塔和壹個美麗的花園。在這個花園裏，小智發現了壹個可疑的影子...
2008年:地獄犬和冰中雪米的花束。小智和他的同伴被卷入了時空的漩渦，當他們清醒過來時，發現自己身處壹個陌生的地方。周圍建築倒掛，天空陰雲密布。這時，普路托突然出現並攻擊了米雪，壹個不具攻擊性的具有特殊能力的精靈。小智他們正準備打起來，有人說了些什麽阻止他們。這是壹個叫無限的學者。他告訴大家，這是壹個“逆向世界”，不能隨便得罪地獄犬。在無窮的幫助下，肖智等人終於回到了正常的現實世界。Zero，壹個野心勃勃的年輕人，要以王龍的力量稱霸世界。他駕駛著壹艘巨大的戰艦作惡。為了拯救世界，肖誌壹行踏上了艱辛的旅程...
2009:超時空。肖誌壹行人繼續旅行，來到了米提納，壹個被豐富的天然河流環繞的小鎮。這個小鎮有著幾千年前的遺跡，肖誌等人正朝著巨石山上的遺跡行進。在這裏，他們遇到了壹個叫“希娜”的女人，她是廢墟的守護者，擁有與神奇寶貝聯系的能力。在希娜的邀請下，讓肖智等人用時空儀講解迪亞魯加、帕盧恰和強子的空間，講講米吉那關於被稱為萬物誕生的神奇嬰兒“造物主”的古老傳說...
2010:佐羅賈庫，幻影霸主。皇冠城是壹座水與綠、古街與現代建築完美融合的城市。為了觀看正在這裏舉行的神奇寶貝足球世界杯，小智壹行向皇冠城進發。旅途中，小智遇到了正在尋找同伴的神奇寶貝“佐羅加”，兩人結伴同行。就在這時，被稱為“佐羅阿克”的神奇寶貝變成了黃蕾、顏地和水軍的樣子，在皇冠城的街道上肆虐。即使是20年後重返這座城市的雪拉比也處於危險之中...
寵物精靈第四部超願(BW)的劇場版，女主角應該是愛麗絲。
2011:維庫蒂尼和黑英雄。它還沒有出來...