1912民國成立，學校劃歸交通部，更名為“交通部交通訓練學院”，增設了電氣工程、電纜電氣、無線電等課程，開創了我國交通人才培養的先河。後來成立了電信系，出了建院士、黃鴻嘉院士等壹大批知名學者。鐵路與電信工程，英語和法語課是北平交大的基礎課。到了民國時期，所有的駕駛、管理、會計、材料方面的人才都是最成功的。
1917年，交通部根據原有班級充實課程，根據鐵路和郵電的不同，將學校改組為“北京鐵路管理學校”和“北京郵電學校”。
1921年，時任北洋政府交通總長的葉恭綽下令將上海工業學院、北京鐵路管理學校、北京郵電學校、唐山工業學院合並，定名為“交大”，設京、滬、唐三校，學校更名為“交大北京學校”。他提出按照歐美的教育制度辦學，成立董事會兼任校長。
1921同年，為整合交大三校學科，平交大無線電、電纜電氣、電氣工程、電氣工程系調至上海，上海大學土木工程系調至湯角大學，部分交通管理教師調至北平。1922年5月，葉因北洋政府派系之爭被迫離職，交大不到壹年即解體。
1923，學校更名為“北京交通大學”。
1928年，南京國民政府取代北洋政府，北京改名北平。6月，學校更名為“交通部第三交通大學”。9月，上海、平、唐再次合並，組成“交大”。5438年6月+10月，學校改為隸屬鐵道部。次年2月，時任鐵道部部長的孫克下令平原獨立，學院更名為“交通大學北京交通管理學院”；7月份更是“交大北京鐵路管理學院”。1937年，盧溝橋事變爆發，萍萍、天津相繼失陷。由於局勢緊張，以培養國內外先進工業技術和管理人才而聞名的國立北平鐵道管理學院的部分學生，在專任教師王方泉的帶領下，乘海船到上海，與上海交通大學校長李接洽，意圖借校舍復學。幾天後，上海爆發抗日戰爭，國民政府遷至武漢。這時，有學生沿京廣鐵路南下，聚集在漢口，組成校友會致電上海，催促王方泉主持復課。面對學生們的緊急召喚，王方泉帶著到達上海的學生四處奔波，乘坐英國公司太古公司的客船，回江西到達漢口。當王方泉得知他在清華任教的學生陪同陳立夫擔任教育部次長時，他親自去找顧商談復學事宜。師生見面時，顧毓琇被王方泉堅持教學、共赴國難的精神深深打動。後來在1925畢業的我校校友張沖的幫助下，拿到了復課的批文。從此，國立交通大學北平鐵道管理學院得以在戰火中復學。
1938 1 10月，交通大學肖平學院並入湖南湘潭縣唐山工業學院，成為“唐山工業學院鐵道管理系”，5月學校遷至該省湘鄉縣。後來由於日軍入侵，學校被迫於5438年6月+次年10月遷至貴州省平嶽縣(今福泉市)。學校壹路流浪，書所剩無幾。在交大朋友金的倡議下，我們向校友們募捐，購買了壹千多冊圖書。2013在北京交通大學的圖書館裏，還可以看到蓋有“重慶交大平原校友捐贈”和校友印章的書籍。2009年，北京交通大學新校史館落成，福泉市政府將平嶽交大僅存的基石和珍貴的歷史實物送至北京交通大學，以紀念抗戰時期國立交大遷至貴州福泉的歷史。
1941 7月，教育部將“交通大學唐山理工學院”更名為“交通大學唐山工程與北平鐵道管理聯合學院”。但是由於反對，這個名字沒有被正式使用。
1942 1，教育部將學校名稱改為國立交通大學貴州分校(含平塘書院和湯圓書院)。兩年後，學校遷至四川璧山縣丁家坳(今重慶)，直至日軍侵華戰爭結束。
1946年4月，元平與唐分離，元平院遷回北平，改名為國立北平鐵路管理學院。65438年至0949年，北平和平解放，中國人民解放軍進駐北平。同年7月，中國人民革命軍事委員會鐵道部下令將國立北平鐵道管理學院、華北交通大學、唐山工業學院改為“中國交通大學”。校長任命橋梁專家茅以升為校長，中國運輸學科創始人、鐵路運輸專家金為副校長。學校本部設在北京，設立唐山學校，增設鐵道電信系。
1950年，中國交通大學被中央人民政府國務院更名為“北方交通大學”。次年，毛澤東校長親筆題寫了北方交通大學的校名，原帖至今保存在北京交通大學歷史博物館。上海交通大學和Xi交通大學校名中的“交大”二字，取自該校原帖。8月，學校從富友街遷至西直門外上元村現址，並增設鐵路業務部。
1952年，北方交通大學被撤銷，北京和唐書院獨立。學校更名為北京鐵道學院。
1953年，鐵道部決定將哈爾濱鐵道學院與北京鐵道學院合並。65438-0956學校新設和恢復鐵道建築(土木工程)、鐵道機械、電氣化工程、應用科學等系。
65438-0958年，北京交通大學電信系、交通系、電氣系部分教師遷至蘭州，唐山鐵道學院部分教師組建蘭州鐵道學院。北京交通大學教授、當時中國鐵路運輸學科的奠基人之壹林達梅教授、中國著名有線通信專家尹教授和著名無線電技術專家班繼超同時被調到蘭州鐵道學院。
1960年，中央批準北京鐵道學院為64所重點大學之壹。
從65438年到0966年文革開始，學校停止了正常的教學和招生。1969年，根據林彪批準的1號令，全校師生全部撤至焦枝鐵路工地，為期壹年。65438-0970，中國人民解放軍鐵道部軍管會向國務院業務組報告，經周恩來總理批準，恢復“北方交通大學”校名，學校擬遷至河北省石家莊市，受河北省和鐵道部雙重領導。然而，由於學校儀器、書籍和資料太多，它仍然在北京運行。65438年至0977年，文革結束，國務院批準學校關系由石家莊轉到北京，同年成立電子工程系。
1981年，北京交通大學成為全國首批博士、碩士學位授予單位，先後批準副教授、教授、博士生導師資格。1985北京交通大學建築系恢復本科招生，學制由1991改為5年。
1994年，學校通過鐵道部組織的“211工程”預審，成為進入“211工程”建設的高校之壹。1995，北京交通大學法律系重新組建。1997、學校“211工程”建設項目可行性研究報告通過鐵道部專家評審。1998年，國家計委批準學校成為九五期間啟動“211工程”的全國61高校之壹。
2000年，原北京電力學院合並，學校從鐵道部劃歸教育部直接管理。2003年，學校恢復使用“北京交通大學”校名。2008年，學校成為“985工程優勢學科創新平臺”項目重點建設高校。
2012年5月，教育部、鐵道部、北京市人民政府簽署共建北京交通大學協議，北京交通大學實現新壹輪“兩部壹市”。
2013年4月，由北京交通大學自主牽頭的“2011計劃”和“軌道交通安全協同創新中心”獲得教育部認可，成為全國首批14中心之壹。