組織對省財政廳和省地方稅務局的財務收支進行審計；組織對省級預算執行和其他財政收支的審計；組織對設區市人民政府預算執行、決算和其他財政收支的審計；組織對省屬國有金融機構和省屬國有資本控股或占主導地位的金融機構的資產、負債、損益進行審計；進行相關的審計調查；組織實施對有關部門和金融機構領導幹部的經濟責任審計；督促被審計單位整改；指導市、縣審計機關的財務審計業務；承辦審計署交辦的其他工作。
行政審計局1
組織對省委辦公廳、省直各部門、省人大辦公廳、省CPPCC辦公廳、省高級人民法院、省檢察院、省民主黨派和省人民團體的財務收支進行審計；組織對省政府辦公廳、省審計廳、省機關事務管理局、省法制局、省新聞出版局、省廣播電影電視局、省人口計生委、省民族宗教局和省政府駐外辦事處的財務收支進行審計；組織對省出版集團公司的資產、負債、損益進行審計；組織對省政府主管部門和設區市人民政府管理的相關專項資金進行審計；組織審計署授權的行政事業單位審計；開展相關專項審計調查；組織實施對有關部門主要領導幹部和國有企業領導人員的經濟責任審計；督促被審計單位整改；指導市、縣審計機關的行政審計業務；承辦審計署交辦的其他工作。
行政審計二司
組織對省文化廳、省科技廳、省體育局、省檔案局、省科學院、省社科院、省農科院、省社科聯、省文聯、省科協的財務收支進行審計；開展相關專項審計調查；組織實施對有關部門主要領導幹部的經濟責任審計；督促被審計單位整改；承辦審計署交辦的其他工作。
行政審計的三個層次
組織對省工信委、省統計局、省工商局、省質監局、省工商聯的財務收支進行審計；開展相關專項審計調查；組織實施對有關部門主要領導幹部的經濟責任審計；督促被審計單位整改；承辦審計署交辦的其他工作。
農業審計局
組織對省農業廳、省林業廳、省水利廳、省扶貧移民辦、省農業綜合開發辦和省委農工部的財務收支進行審計；組織對省政府主管部門和設區市人民政府管理的農林水扶貧移民專項資金進行審計；組織國家審計署授權的農林水項目審計；開展相關專項審計調查；組織實施對有關部門主要領導幹部的經濟責任審計；督促被審計單位整改；指導市、縣審計機關的農林水審計業務；承辦審計署交辦的其他工作。
資源環境保護審計局
組織對省國土資源廳、省環境保護廳、省地質礦產局和省測繪局的財務收支進行審計；組織對省政府主管部門和設區市人民政府管理的資源能源、生態環境保護、節能減排資金和項目進行審計；組織對鄱陽湖生態經濟區資源環境保護專項資金和項目的審計；組織對審計署授權的資源和環境保護專項項目的審計；開展相關專項審計調查；組織實施對有關部門主要領導幹部的經濟責任審計；督促被審計單位整改；指導市、縣審計機關的資源、能源和環境保護審計業務；承辦審計署交辦的其他工作。
固定資產投資審計辦公室1
組織審計省發展和改革委員會、鄱陽湖生態經濟區建設辦公室、省住房和城鄉建設廳的財務收支；組織對以省投資為主的農業、林業、水利、基礎設施和基礎產業、工業、高新技術產業等建設項目的預算執行和決算進行審計；組織對其他關系國家利益和社會公共利益的重大建設項目的審計；組織審計署授權的固定資產投資項目審計；開展相關專項審計調查；組織實施對有關部門主要領導幹部的經濟責任審計；督促被審計單位整改；指導市、縣審計機關的固定資產投資審計業務；承辦審計署交辦的其他工作。
固定資產投資審計二司
組織對省人防辦的財務收支進行審計；組織對省建工集團公司的資產、負債、損益進行審計；組織對以省投資為主的科技、教育、文化、衛生、體育等建設項目的預算執行情況和決算進行審計；開展相關專項審計調查；組織實施對有關部門主要領導幹部和國有企業領導人員的經濟責任審計；督促被審計單位整改；承辦審計署交辦的其他工作。
經貿審計局1
組織對省交通廳、省國資委、省國防科工辦、省煤炭銀行辦公室的財務收支進行審計；組織對省屬國有企業和省屬國有資本控股或占主導地位的企業(不含金融企業和省建工集團)的資產、負債和損益進行審計；組織審計署授權的國有企業審計；開展相關專項審計調查；組織實施對有關部門主要領導幹部和國有企業領導人員的經濟責任審計；督促被審計單位整改；組織指導和監督內部審計工作；指導市、縣審計機關的企業審計業務；承辦審計署交辦的其他工作。
經濟貿易審計二處
組織對省商務廳、省糧食局、省旅遊發展委員會、省安監局、省核地質局、省煤田地質局、省有色地質勘查局、省供銷社、省機辦、省輕工辦的財務收支進行審計；開展相關專項審計調查；組織實施對有關部門主要領導幹部的經濟責任審計；督促被審計單位整改；承辦審計署交辦的其他工作。
社會保障審計局
組織對省人保廳、省民政廳、省衛生廳等部門的財務收支進行審計；組織對省政府主管部門、設區市人民政府等單位委托省政府及其部門管理的社會保障資金、社會捐贈資金和民政衛生資金進行審計；開展相關專項審計調查；組織實施對有關部門主要領導幹部的經濟責任審計；督促被審計單位整改；指導市、縣審計機關的社會保障審計業務；承辦審計署交辦的其他工作。
利用外資審計局
組織對外事僑務辦公室、臺灣事務辦公室和僑聯的財務收支進行審計；組織對國際組織和外國政府援助貸款項目的財務收支進行審計；組織對省屬國有資產控股或占主導地位的中外合資企業的資產、負債、損益進行審計；開展相關專項審計調查；組織實施對有關部門主要領導幹部的經濟責任審計；督促被審計單位整改；指導市縣審計機關利用外資開展審計業務；承辦審計署交辦的其他工作。
機關後勤服務中心
江西省審計廳後勤服務中心的主要職能是:服務、管理、協調和保障。其主要職責是:
(壹)、認真貫徹國家和省有關機關後勤服務中心的方針、政策，負責制定本部門及所屬單位的後勤建設規劃、各項管理規則、制度、服務措施、標準、業務計劃和目標，並認真組織實施；
(二)、負責管理和使用贛深賓館、服務站、廬山訓練基地和機關所屬的門面房；
(三)承擔江西省審計廳授權的經營性和非經營性國有資產、設施、設備的管理，負責江西省審計廳辦公樓和自辦宿舍區的通訊、安保、供電、供水、供氣、保潔、綠化等物業管理；
(四)、負責公務車輛的購置、調配、調度、維修和燃油供應管理，負責駕駛員的安全教育，協調處理交通事故；
(五)、負責江西省審計廳基本建設項目的實施，以及住房實物分配和貨幣分配；
(六)、開展江西省審計廳的愛國衛生、社會治安綜合治理等工作；
(七)會同有關部門承擔江西省審計廳機關及直屬單位的政府采購工作；
(八)、協助做好以江西省審計廳名義召開的會議和公務接待工作；
(九)、承擔辦公用品、電腦耗材等的采購、發放和管理工作。，並配合有關部門做好江西省審計廳的福利工作；
(十)、根據江西省審計廳撥付的預算，管理和使用後勤保障相關專項資金。負責後勤服務中心及其下屬單位的計劃、財務、業務拓展和管理；
(十壹)、負責後勤服務中心及其下屬單位的幹部職工管理、人事任免、調配，按江西省審計廳規定的管理權限辦理；
(十二)、負責後勤服務中心及其下屬單位的黨群工作和精神文明、紀檢監察工作；
(十三)、承辦江西省審計廳領導交辦的其他事項。
信息中心
江西省審計廳信息中心履行協調指導全省審計機關信息化建設和直接承擔審計機關信息化建設的職能。是江西省審計廳主管審計信息化的專門機構，對全省審計機關和江西省審計機關信息化事項實行集中管理。主要職責是:
壹、組織、協調、指導、管理、監督和檢查全省審計機關和江西省審計廳的信息化建設，承擔廳信息化建設領導小組的日常工作；
二、貫徹執行審計署和省政府制定的方針、政策、技術規範和標準，研究制定、組織實施全省審計機關和辦事機構的信息化規劃、計劃和方案；
三、建設江西省審計廳信息網絡及其配套設施，建立並落實網絡運行的安全保障機制；
4.在全省審計機關和江西省審計廳推廣應用國家審計署統壹開發的審計實施系統、審計管理系統等審計應用軟件，開展互補性、適應性軟件研發和引進；
五、建立全省審計機關和江西省審計廳信息資源采集、存儲、處理系統和辦公數據庫，從事信息資源的開發和利用；
六、組織全省審計機關和江西省審計廳的信息技術專業培訓、考試，開展信息技術應用成果交流、評價、考核；
7.管理和維護江西省審計廳信息網絡、互聯網站、計算機及其相關設備，承擔計算機及其相關設備的選型和配置；
八、編制江西省審計廳信息化建設資金使用計劃，按照批準的預算和建設進度、規定的程序和權限用於專項項目和專項支出；
九、為省內審計機關和辦事機構提供信息技術咨詢和服務，協助江西省審計廳有關部門實施計算機審計和辦公自動化；
十、承辦江西省審計廳領導交辦的其他工作。
紀檢組(監察室)
是省紀委(省監察廳)的派駐機構。