1.碭山校區:位於浙江省嘉興市南湖區水口鎮碭山湖畔。這個校園建在占地約2000畝的森林中，綠樹成蔭，環境優美，被譽為“生態學校”。碭山校區主要涵蓋理、工、文、管、藝五個學科門類，涵蓋本科生和研究生等多個層次。校園設施齊全，有現代化的教學樓、實驗室、圖書館、美術館、運動場館和學生公寓。
2.沈君如校區:位於浙江省臺州市椒江區金山路333號。這個校區是由原臺州師範學院和同濟大學合作建立的。