十壹專業:臨床醫學、口腔醫學、護理、助產學、藥學、醫學檢驗技術、衛生檢驗檢疫技術、中醫、康復技術、針灸推拿、醫學影像技術。
其中，臨床醫學和護理被財政部列為提高高職院校專業服務業發展能力的專業；臨床醫學、護理、中醫、醫學檢驗技術教學團隊被評為省級教學團隊；護理、助產、醫學檢驗技術專業被評為省級特色專業；基礎護理學、病理學、人體解剖學、細胞生物學、醫學遺傳學被評為省級精品課程。
學院教學儀器設備總值5200萬元，擁有網絡體檢診斷室、護理實訓室、數碼互動顯微鏡室、口腔實訓室等89個現代化醫學實驗室和信息技術實驗室。成立平涼皇甫謐研究院、平涼崆峒研究院、平涼崆峒健康文化研究院、平涼皇甫謐隆堯研究院、甘肅醫學院中醫藥研究中心。學校圖書館藏書89.7萬冊，中外文期刊816種。
依托現代數字技術，學院還搭建了完善的文獻資源、在線視頻教學、電子閱讀等網絡公共服務平臺。