2.目的不同:醫院重大經濟項目分析評價的目的是幫助醫院更好地計劃、管理和控制各項經濟活動，提高經濟效益和社會效益。審計報告的目的是發現和糾正醫院財務管理中存在的問題和風險，保證醫院財務報表的真實、準確和完整。
3.範圍不同:醫院重大經濟項目的分析與評價範圍廣泛，涉及醫院的各項經濟活動和項目，如投資決策、物資采購、人事管理等。審計報告的範圍比較窄，主要針對醫院的財務管理，如財務報表、會計核算、內部控制等。
4.主體不同:醫院重大經濟項目的分析評價通常由專業機構或專業人員進行，評價結果不具有法律效力。審計報告由獨立的審計機構或審計人員進行，其結果具有法律效力。