新疆大學圖書館有工作人員107人，包括漢族、維吾爾族、哈薩克族、烏茲別克族、回族和滿族，少數民族工作人員47人，占圖書館總人數的43%。全館人員中，高級職稱17人，中級職稱49人。圖書館設館長1名，黨支部書記兼副館長1名，副館長3名。下設辦公室、流通部、期刊部、信息服務中心、Calis新疆維吾爾自治區文獻信息服務中心辦公室、古籍與地方文獻部、采編部、技術部。
新疆大學圖書館自動化管理系統采用江蘇匯文軟件有限公司開發的匯文文獻信息服務系統，該系統基於大型圖書館的管理模式，采用分館和總館兩層網絡架構模式，采用大型Oracle關系數據庫管理系統。該系統包括采訪、編目、流通、期刊管理、公共查詢、系統管理、OPAC查詢、Z 39.50 * *八大模塊，可以全面細致地管理圖書館的日常業務。
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