區別1。他們有不同的權利。武警支隊歸武警總隊管轄和指揮；武警總隊的級別高於武警支隊。
區別二。不同的設置。武警總隊主要是省、自治區、直轄市設立的武警部隊的壹級機構，也是各省、自治區、直轄市政府機構中的軍事部門，受公安部門領導。武警支隊是武警部隊在地區壹級(地級市、地、盟)設立的機構，隸屬武警總隊。
區別三。層次不同。由於武警總隊分布在不同地區，不同的省或直轄市，在1995 -1999中，各地區武警總隊由正師級提升為副師級。武警支隊屬於團級。
區別四，住院醫生不壹樣。武警總隊壹般設在各省或直轄市的省會城市。但武警支隊駐紮面廣，市縣區都有中隊或大隊、站、站。
參考資料:
武警_百度百科
武警總隊_百度百科