成蟲以其細長的前段插入腸粘膜甚至腸粘膜下層，從組織和血液中吸收營養。再加上分泌物的刺激，腸粘膜組織出現輕度炎癥或點狀出血，還可見上皮細胞變性壞死。少數患者因腸壁炎癥、細胞增生、腸壁增厚形成肉芽腫。有學者用51Cr觀察，發現每條鞭蟲每天使宿主失血約0.005ml，所以壹般患者沒有貧血癥狀。鞭蟲引起的慢性失血，嚴重感染時(即寄生蟲數量超過800)可導致缺鐵性貧血。此外，免疫學研究表明，人體感染鞭蟲後可產生壹定的免疫力。動物實驗結果表明，鞭蟲的桿狀體是功能性抗原的主要來源。
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