1898年，美國人入侵馬尼拉，取代了西班牙人在菲律賓的統治，隨後又征服了附近的尼格羅人，將周圍的城鎮和地區並入馬尼拉，從而逐漸擴大了馬尼拉。
1901 7月31日，馬尼拉被定為菲律賓特別市，成為美國統治菲律賓的基地。此後，大型銀行、公司、酒店等高層建築在巴士河北岸的商業區拔地而起。
1942年，日本取代美國在菲律賓。二戰中，馬尼拉遭到嚴重破壞，城堡要塞周圍的建築全部被炮火摧毀。
1946年7月4日，菲律賓正式獨立，馬尼拉被定為首都。
今天，馬尼拉是壹個熱帶花園城市，外觀整潔，是壹個國際商業港口。