1991年6月，經四川省政府批準，撤銷吳灘鄉，設立吳灘鎮，管轄區域不變，下轄16個村(街道從1起分為兩個居)。
1994 1月，撤銷武潭區建制，梯子鄉並入武潭鎮管轄。在此期間，政府的內部機構基本保持不變。下轄23個村。
2001、5月，江津市再次實施鎮街建制調整和政府機構改革。石梁和龍鄉鎮長口村、長沖鎮現屬吳灘鎮管轄。政府內設機構由原來的15(黨政辦、財政所、民政所、計生辦、綜治辦、農辦、小城鎮辦、移民辦、文化站、廣播電視臺、國土所、司法所、婦聯、團委、武裝部)縮減為11(黨政辦)，7月份將原來的32個村調整合並為11個村
2005年6月至2005年10月，實施“精鎮強村”戰略。將政府原有的5個辦公室、3個中心合並為4個1中心(黨政綜合辦公室、社會事務辦公室、經濟發展辦公室、保障辦公室、農業服務中心)。二級班子負責人競爭上崗，機關工作人員實行雙向選擇。村級建制由11合並為7個村(平安、金子、郎家、邢家、仙龍、華亭、寶塔社區)。今後將維持現行的鎮村建制，不再調整機構。