目前的CERs定價方法主要采用微觀經濟學的邊際思想。根據邊際分析的基本原理，碳資產定價時，首先要考慮邊際成本和邊際收益。如果邊際收益大於邊際成本，定價就是理性的。但是如果邊際收益小於邊際成本，那麽定價就是不合理的。只有當邊際收益和邊際成本相等時，才會達到均衡價格，價格才會最優化。
現實中，CCER定價方法主要分為三類:邊際減排成本定價、實物期權定價和影子價格定價。