元朝:元末在澎湖設置巡檢司，管理澎湖和琉球(臺灣省)。
清朝:明末荷蘭殖民者入侵臺灣省後，鄭成功於161年領兵收復臺灣省，臺灣省於1662年重回祖國懷抱。1683年，清軍接管臺灣省，設立臺灣府，隸屬福建省。