對於呼吸系統:PM2.5可以沈積在肺泡區，溶解在血液中，作用於全身；不溶性部分沈積在肺部，誘發或加重炎癥。
對於心血管系統:PM2.5刺激肺部迷走神經，引起主要神經紊亂，影響心臟，可直達心臟，導致心肌梗死。
對於生殖系統來說，PM2.5中附著了很多重金屬、多環芳烴等有害物質，明顯增加了致癌、致畸、突變的概率。容易造成胎兒生長遲緩和低出生體重兒。毒藥可以跳過胎盤。
對於血液系統:PM2.5可引起血液系統的毒性，誘發血栓的形成，還可引起凝血異常，導致血液粘度增加，導致心血管疾病。