1994通過中華人民共和國衛生部二級甲等醫院評審。1995被世界衛生組織(世衛組織)認定為愛嬰醫院，1998以來連續五年被評為上海市文明單位，1999被評為上海市關愛老人十大特色基地之壹，2003年被評為青浦區臺胞臺商定點醫院。醫院先後被授予“青浦區五好黨支部、六好黨委、思想政治工作先進單位”等稱號。
2002年6月5438日至10月5日，青浦區衛生局與復旦大學附屬中山醫院聯合成立復旦大學附屬中山醫院青浦分院和上海市青浦區中心醫院。