這種建築做法在古代建築中極為罕見，在當時的天津是壹種高檔的木亭。寺廟周圍的墻壁上畫有許多壁畫，雕梁畫棟，栩栩如生。
後來由於年久失修，玉皇閣建築破敗不堪，墻內14檐柱全部腐朽，上下檐翼角嚴重變形，瓦屋面瓦和脊飾破損。
屋頂灰背開裂，漏雨嚴重，油飾地面已剝落，室內外彩畫陳舊難辨，已失去保護木質構件和美化建築的作用。地面、桌面、墻壁、地板、欄桿都有不同程度的損壞。
因此，朝廷按照“修舊如舊，恢復原貌”的計劃，利用原有的建築材料，根據史料最大限度地恢復了壹些風雨侵蝕嚴重的部位。