2001年，在河南省林業廳的協調下，決定在上述三個省級自然保護區的基礎上，申請建立國家級自然保護區。
2003年6月，國務院在上述三門峽黃河國有林場、孟州市國有林場三個省級保護區的基礎上，批準建立河南黃河濕地國家級自然保護區。