未來，舟山港綜合保稅區將涉及保稅加工產業、保稅物流產業、大宗商品倉儲物流貿易產業、航運服務業、保險金融業等主要產業，重點培育船舶與海洋工程交易租賃、國際進口商品展示交易、大宗商品保稅交易三大市場。
夏文忠表示，為確保綜保區建設順利進行，舟山市將在綜保區規劃研究的基礎上，啟動港口岸線利用、基礎設施配套、產業發展等方面的控制性詳細規劃和專項規劃，做好規劃建設工作方案。同時，做好土地置換、征收及相關政策。
浙江省副省長、舟山市委書記梁黎明表示，舟山港綜合保稅區將依托獨特的區位優勢，利用獨特的功能和政策優勢，大力發展海洋經濟，使舟山群島新區成為現代海洋產業基地、重要的進口商品基地和大宗商品國際物流配送中心，成為中國環太平洋經濟圈的橋頭堡。