专利分析的价值已被众多企业战略应用的实例所验证，但也不能过度估计其分析的准确性及合理性，专利分析在实际的应用中还存在一些缺陷与不足。
首先，专利数据并不能完全代表整个领域的创新活动。这是因为并非每个专利都具有商业创新价值，另一方面，企业选择保守商业秘密来保护其发明创新 技术上，这些都是无法通过简单的专利分析来发现的。
此外，专利分析存在明显的时滞，因为申请日期和公开日期之间通常有 18 个月的间隔 ，对于一个正在进一步开发与现有产品的专利技术的企业来说，这个时滞将影响直接专利分析预测结果的准确性。
再次，专利只是申请复杂的企业活动的一个 因此，缺陷的专利分析并不能准确地评价企业市场及其活动的数据。因此专利分析仍然完全存在一些不足之处，因此我们在利用专利分析的时候，应与其他经济、技术等竞争信息 源配合起来，才能帮助企业更好的实施专利战略，辅助企业在市场竞争中做出正确的决策。