全自動生化分析儀屬於光學式分析儀器，它基於物質對光的選擇性吸收，即分光光度法。單色器將光源發出的復色光分成單色光，特定波長的單色光通過盛有樣品溶液的比色池，光電轉換器將透射光轉換為電信號後送入信號處理系統進行分析。
分析全自動生化分析儀可以說是在傳統的分光光度計的基礎上發展來的。從結構上來說，它包含分光光度計的主要組成部分，如 : 光源、單色器(色散裝置)、比色池、檢測器等；另外，它還包括生化分析所需的特有部分，如：加樣系統、清洗系統、溫控系統、軟件系統等。
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