DNA的序列分析是進壹步研究和改造目的基因的基礎。目前用於測序的技術主要有Sanger等（1977）發明的雙脫氧鏈末端終止法與Gilbert（1977）發明的化學降解法。這兩種方法在原理上差異很大，但都是根據核苷酸在某壹固定的點開始，隨機在某壹個特定的堿基處終止，產生A，T，C，G四組不同長度的壹系列核苷酸，然後在尿素變性的PAGE膠上電泳進行檢測，從而獲得DNA序列。目前Sanger測序法得到了廣泛的應用。